More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2833 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 778 aa  1552    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.15 
 
 		 752 aa  650    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.96 
 
 		 752 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.67 
 
 		 733 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.46 
 
 		 718 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.02 
 
 		 722 aa  596  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.17 
 
 		 741 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.04 
 
 		 741 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.04 
 
 		 741 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.57 
 
 		 753 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.05 
 
 		 733 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.56 
 
 		 736 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.62 
 
 		 737 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.36 
 
 		 733 aa  572  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.5 
 
 		 733 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 723 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.17 
 
 		 760 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.7 
 
 		 746 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.08 
 
 		 725 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  45.95 
 
 		 739 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.03 
 
 		 747 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.8 
 
 		 750 aa  531  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.04 
 
 		 758 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.96 
 
 		 747 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.39 
 
 		 749 aa  514  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.63 
 
 		 726 aa  511  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.56 
 
 		 750 aa  505  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  43.77 
 
 		 741 aa  501  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.49 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.12 
 
 		 741 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.75 
 
 		 781 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.56 
 
 		 756 aa  490  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.81 
 
 		 757 aa  489  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.35 
 
 		 748 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  41.52 
 
 		 739 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.15 
 
 		 730 aa  422  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.71 
 
 		 767 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.83 
 
 		 714 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.04 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.35 
 
 		 712 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.65 
 
 		 815 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.91 
 
 		 772 aa  416  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.8 
 
 		 707 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.78 
 
 		 772 aa  412  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.9 
 
 		 700 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.23 
 
 		 862 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.61 
 
 		 829 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.8 
 
 		 689 aa  406  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.54 
 
 		 706 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.55 
 
 		 689 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.58 
 
 		 706 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.3 
 
 		 706 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.65 
 
 		 720 aa  399  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.16 
 
 		 704 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.89 
 
 		 685 aa  395  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.26 
 
 		 703 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  34.23 
 
 		 818 aa  394  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.47 
 
 		 778 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.32 
 
 		 740 aa  390  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  35.04 
 
 		 792 aa  392  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.82 
 
 		 812 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.19 
 
 		 765 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.34 
 
 		 698 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.63 
 
 		 818 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.26 
 
 		 682 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.75 
 
 		 817 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3701  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.58 
 
 		 707 aa  389  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.42 
 
 		 685 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.38 
 
 		 779 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.6 
 
 		 846 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.04 
 
 		 701 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.69 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.68 
 
 		 682 aa  385  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.8 
 
 		 904 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.76 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.54 
 
 		 682 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.76 
 
 		 682 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.32 
 
 		 683 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.76 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.67 
 
 		 772 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.76 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.67 
 
 		 753 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.09 
 
 		 685 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.31 
 
 		 819 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.24 
 
 		 819 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.68 
 
 		 657 aa  382  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.21 
 
 		 728 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.55 
 
 		 686 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.6 
 
 		 703 aa  382  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.41 
 
 		 682 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.25 
 
 		 682 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.47 
 
 		 702 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.94 
 
 		 672 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.54 
 
 		 832 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.42 
 
 		 846 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.72 
 
 		 701 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.23 
 
 		 692 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.46 
 
 		 695 aa  377  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.38 
 
 		 681 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.56 
 
 		 694 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>