More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2279 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.26 
 
 
722 aa  739    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.6 
 
 
758 aa  849    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.05 
 
 
733 aa  740    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.19 
 
 
747 aa  859    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.94 
 
 
748 aa  806    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.26 
 
 
733 aa  719    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.87 
 
 
723 aa  693    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  53.5 
 
 
739 aa  681    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.87 
 
 
726 aa  711    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.28 
 
 
725 aa  715    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.05 
 
 
747 aa  684    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.84 
 
 
746 aa  674    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.1 
 
 
736 aa  750    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.24 
 
 
757 aa  716    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.71 
 
 
733 aa  699    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.04 
 
 
759 aa  688    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.82 
 
 
756 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.03 
 
 
718 aa  734    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
749 aa  1471    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.97 
 
 
733 aa  706    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.83 
 
 
760 aa  671    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.3 
 
 
750 aa  815    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.37 
 
 
750 aa  633  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.51 
 
 
781 aa  630  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 
741 aa  629  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.55 
 
 
752 aa  602  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  48.25 
 
 
741 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.53 
 
 
730 aa  566  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.88 
 
 
752 aa  567  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.96 
 
 
737 aa  556  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.89 
 
 
753 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  46.77 
 
 
739 aa  558  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.3 
 
 
741 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.37 
 
 
741 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.37 
 
 
741 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.39 
 
 
778 aa  512  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  38.64 
 
 
792 aa  476  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1087  RecG-like helicase  44.62 
 
 
943 aa  437  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.56 
 
 
720 aa  430  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.33 
 
 
704 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.27 
 
 
706 aa  423  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.87 
 
 
846 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.44 
 
 
706 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.41 
 
 
786 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.73 
 
 
846 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.66 
 
 
818 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.72 
 
 
819 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.72 
 
 
819 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.95 
 
 
683 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.27 
 
 
685 aa  412  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.6 
 
 
812 aa  412  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.91 
 
 
815 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.48 
 
 
842 aa  403  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.64 
 
 
829 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.92 
 
 
842 aa  406  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.7 
 
 
740 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.12 
 
 
682 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.59 
 
 
703 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1662  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.03 
 
 
750 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.655475  normal  0.0136828 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  33.74 
 
 
818 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.75 
 
 
818 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.93 
 
 
767 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.5 
 
 
678 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.81 
 
 
822 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.26 
 
 
712 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.1 
 
 
827 aa  399  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.81 
 
 
680 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.47 
 
 
818 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.9 
 
 
737 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.68 
 
 
818 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.31 
 
 
832 aa  399  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.48 
 
 
686 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.91 
 
 
689 aa  399  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05590  RecG-like helicase  38.82 
 
 
741 aa  395  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.37968  normal  0.810679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.84 
 
 
700 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.66 
 
 
717 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.73 
 
 
703 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.7 
 
 
818 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.21 
 
 
815 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  33.7 
 
 
700 aa  396  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.2 
 
 
702 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.48 
 
 
706 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.71 
 
 
779 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.05 
 
 
778 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4161  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.19 
 
 
729 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.81 
 
 
704 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3737  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.19 
 
 
665 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4530  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.7 
 
 
729 aa  392  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.41 
 
 
706 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.45 
 
 
685 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.4 
 
 
772 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.21 
 
 
817 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0860  helicase domain protein  38.44 
 
 
730 aa  392  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.313479  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.96 
 
 
719 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.28 
 
 
701 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.35 
 
 
706 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.36 
 
 
701 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4673  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.93 
 
 
729 aa  389  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.67 
 
 
704 aa  389  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.75 
 
 
862 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>