More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1674 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.68 
 
 		 736 aa  703    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.11 
 
 		 718 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.88 
 
 		 733 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.53 
 
 		 757 aa  692    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.93 
 
 		 746 aa  672    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 750 aa  1484    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.74 
 
 		 733 aa  719    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.32 
 
 		 722 aa  714    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.3 
 
 		 749 aa  814    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.03 
 
 		 748 aa  725    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.27 
 
 		 747 aa  737    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.23 
 
 		 733 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.34 
 
 		 747 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.1 
 
 		 725 aa  662    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.54 
 
 		 723 aa  656    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.55 
 
 		 733 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.27 
 
 		 756 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.62 
 
 		 758 aa  758    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.18 
 
 		 726 aa  632  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.14 
 
 		 759 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.66 
 
 		 760 aa  618  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  48.79 
 
 		 739 aa  614  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.14 
 
 		 752 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.2 
 
 		 750 aa  598  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.46 
 
 		 741 aa  592  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  45.56 
 
 		 741 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.97 
 
 		 781 aa  554  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  45.34 
 
 		 739 aa  547  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.39 
 
 		 730 aa  534  1e-150  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.97 
 
 		 753 aa  522  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.37 
 
 		 741 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.63 
 
 		 741 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.33 
 
 		 778 aa  511  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.63 
 
 		 741 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.88 
 
 		 752 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.97 
 
 		 737 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  34.82 
 
 		 792 aa  433  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.48 
 
 		 720 aa  429  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  37.11 
 
 		 700 aa  419  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.82 
 
 		 815 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.07 
 
 		 819 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.07 
 
 		 819 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.68 
 
 		 818 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.44 
 
 		 702 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.02 
 
 		 701 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.64 
 
 		 703 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.81 
 
 		 704 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.64 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.64 
 
 		 704 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.96 
 
 		 701 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.08 
 
 		 689 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.64 
 
 		 704 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.78 
 
 		 829 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.96 
 
 		 682 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.8 
 
 		 786 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.16 
 
 		 846 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.7 
 
 		 706 aa  397  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.8 
 
 		 683 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.1 
 
 		 695 aa  399  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.24 
 
 		 706 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.4 
 
 		 832 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.58 
 
 		 818 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.67 
 
 		 706 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.53 
 
 		 706 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.45 
 
 		 772 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.02 
 
 		 846 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.04 
 
 		 842 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.21 
 
 		 818 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.91 
 
 		 812 aa  395  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.75 
 
 		 767 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0908  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.71 
 
 		 703 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.92 
 
 		 815 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.24 
 
 		 827 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.06 
 
 		 785 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.23 
 
 		 702 aa  395  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.55 
 
 		 712 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.13 
 
 		 790 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.14 
 
 		 685 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.83 
 
 		 691 aa  392  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.28 
 
 		 717 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.74 
 
 		 706 aa  391  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.58 
 
 		 818 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.26 
 
 		 817 aa  392  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.89 
 
 		 685 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.67 
 
 		 691 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.38 
 
 		 700 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.14 
 
 		 693 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0322  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.52 
 
 		 715 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.732592  normal  0.0359852 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.4 
 
 		 689 aa  388  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.72 
 
 		 679 aa  389  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.31 
 
 		 682 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.99 
 
 		 777 aa  389  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  36 
 
 		 862 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.6 
 
 		 691 aa  388  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.24 
 
 		 818 aa  388  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.34 
 
 		 765 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.9 
 
 		 686 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.72 
 
 		 771 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.8 
 
 		 778 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.21 
 
 		 772 aa  387  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>