More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3200 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.8 
 
 		 733 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.34 
 
 		 718 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.93 
 
 		 722 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.03 
 
 		 753 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 752 aa  1515    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.09 
 
 		 741 aa  657    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.09 
 
 		 741 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.09 
 
 		 741 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.98 
 
 		 752 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.15 
 
 		 778 aa  633  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.92 
 
 		 760 aa  630  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.94 
 
 		 733 aa  621  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.71 
 
 		 737 aa  615  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.21 
 
 		 746 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.49 
 
 		 725 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.83 
 
 		 723 aa  611  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.06 
 
 		 736 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.95 
 
 		 726 aa  598  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.2 
 
 		 733 aa  597  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.22 
 
 		 733 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.99 
 
 		 749 aa  589  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.09 
 
 		 747 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.62 
 
 		 750 aa  578  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.74 
 
 		 741 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.87 
 
 		 747 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.35 
 
 		 758 aa  572  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  46.12 
 
 		 739 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.2 
 
 		 757 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.21 
 
 		 756 aa  556  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.47 
 
 		 748 aa  551  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.52 
 
 		 750 aa  549  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.9 
 
 		 759 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.13 
 
 		 781 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  44.03 
 
 		 739 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  42.55 
 
 		 741 aa  505  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.72 
 
 		 730 aa  469  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.5 
 
 		 720 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.83 
 
 		 818 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.21 
 
 		 819 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.02 
 
 		 704 aa  410  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.08 
 
 		 819 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.88 
 
 		 706 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.23 
 
 		 827 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.99 
 
 		 706 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.48 
 
 		 706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  33.55 
 
 		 818 aa  405  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3701  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.07 
 
 		 707 aa  405  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.65 
 
 		 707 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.43 
 
 		 702 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.73 
 
 		 740 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.09 
 
 		 818 aa  399  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.27 
 
 		 683 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.06 
 
 		 818 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.6 
 
 		 862 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.75 
 
 		 818 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.73 
 
 		 832 aa  393  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.77 
 
 		 815 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.34 
 
 		 786 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.47 
 
 		 728 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.16 
 
 		 842 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.74 
 
 		 683 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.61 
 
 		 815 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.07 
 
 		 767 aa  392  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  32.61 
 
 		 792 aa  391  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.15 
 
 		 818 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.36 
 
 		 719 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.24 
 
 		 753 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.04 
 
 		 778 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.86 
 
 		 842 aa  391  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.55 
 
 		 691 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.94 
 
 		 700 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.51 
 
 		 779 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.09 
 
 		 817 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.09 
 
 		 772 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.75 
 
 		 703 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.6 
 
 		 685 aa  389  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.4 
 
 		 827 aa  389  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.56 
 
 		 822 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.11 
 
 		 712 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.83 
 
 		 703 aa  385  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.67 
 
 		 904 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.09 
 
 		 908 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.93 
 
 		 737 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.18 
 
 		 695 aa  382  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.24 
 
 		 689 aa  386  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.59 
 
 		 686 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.28 
 
 		 829 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.23 
 
 		 846 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.71 
 
 		 688 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.77 
 
 		 701 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.14 
 
 		 846 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.45 
 
 		 689 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0884  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.2 
 
 		 692 aa  382  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.42 
 
 		 704 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  34.56 
 
 		 700 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.47 
 
 		 712 aa  382  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.21 
 
 		 691 aa  382  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.28 
 
 		 772 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.36 
 
 		 859 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3359  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.01 
 
 		 902 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>