More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2247 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.66 
 
 
747 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.49 
 
 
760 aa  640    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.93 
 
 
733 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.31 
 
 
747 aa  666    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.24 
 
 
749 aa  695    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.53 
 
 
750 aa  676    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.29 
 
 
733 aa  712    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
757 aa  1513    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.65 
 
 
736 aa  674    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.45 
 
 
725 aa  660    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  50 
 
 
746 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  51.26 
 
 
739 aa  650    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.52 
 
 
748 aa  656    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  51 
 
 
733 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.59 
 
 
723 aa  653    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.26 
 
 
758 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.54 
 
 
722 aa  677    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.53 
 
 
718 aa  672    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  81.1 
 
 
756 aa  1203    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.27 
 
 
733 aa  634  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.4 
 
 
726 aa  615  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.09 
 
 
750 aa  615  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.46 
 
 
759 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.14 
 
 
741 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.64 
 
 
730 aa  592  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.26 
 
 
781 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.2 
 
 
752 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.53 
 
 
741 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.53 
 
 
741 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.53 
 
 
741 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.82 
 
 
752 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.58 
 
 
753 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  44.3 
 
 
741 aa  534  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.64 
 
 
737 aa  528  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  42.18 
 
 
739 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.81 
 
 
778 aa  475  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0316  putative ATP-dependent DNA helicase RecG  37.06 
 
 
792 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.151323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.15 
 
 
704 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1087  RecG-like helicase  40.75 
 
 
943 aa  402  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.55 
 
 
815 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.31 
 
 
819 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.38 
 
 
689 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.31 
 
 
819 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.9 
 
 
765 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.49 
 
 
700 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.98 
 
 
703 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.65 
 
 
720 aa  386  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.08 
 
 
706 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.11 
 
 
685 aa  386  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.49 
 
 
685 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  34.86 
 
 
818 aa  385  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.71 
 
 
717 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.85 
 
 
818 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.16 
 
 
680 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.88 
 
 
786 aa  385  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.44 
 
 
692 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.86 
 
 
740 aa  381  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.71 
 
 
846 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.53 
 
 
767 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.85 
 
 
846 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.7 
 
 
818 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.86 
 
 
818 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.84 
 
 
698 aa  376  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.84 
 
 
683 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.07 
 
 
701 aa  378  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.51 
 
 
829 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.75 
 
 
695 aa  378  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.85 
 
 
779 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.79 
 
 
706 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.74 
 
 
817 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.22 
 
 
842 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  34.62 
 
 
700 aa  375  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.05 
 
 
702 aa  374  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.07 
 
 
772 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.62 
 
 
842 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.06 
 
 
753 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.22 
 
 
818 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.01 
 
 
688 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.02 
 
 
781 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.74 
 
 
702 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.74 
 
 
683 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.36 
 
 
706 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.35 
 
 
812 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.34 
 
 
818 aa  365  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.19 
 
 
719 aa  365  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.92 
 
 
681 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.19 
 
 
707 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.88 
 
 
714 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.86 
 
 
737 aa  363  6e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.51 
 
 
827 aa  363  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.93 
 
 
904 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.43 
 
 
827 aa  363  7.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.3 
 
 
815 aa  363  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.2 
 
 
778 aa  362  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.45 
 
 
792 aa  361  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.24 
 
 
712 aa  360  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.25 
 
 
771 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.25 
 
 
771 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.75 
 
 
785 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.09 
 
 
728 aa  360  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>