More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12988 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.23 
 
 		 753 aa  938    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 737 aa  1494    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  49 
 
 		 733 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.98 
 
 		 741 aa  966    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.13 
 
 		 722 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.98 
 
 		 741 aa  966    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.79 
 
 		 752 aa  950    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.12 
 
 		 741 aa  966    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.71 
 
 		 752 aa  628  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.1 
 
 		 733 aa  622  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.5 
 
 		 718 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.8 
 
 		 726 aa  609  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.6 
 
 		 725 aa  596  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.44 
 
 		 736 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.4 
 
 		 733 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.61 
 
 		 723 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.73 
 
 		 760 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.12 
 
 		 733 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.92 
 
 		 748 aa  570  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.62 
 
 		 778 aa  567  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.99 
 
 		 749 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  47.4 
 
 		 739 aa  561  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.1 
 
 		 747 aa  555  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.01 
 
 		 746 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.74 
 
 		 750 aa  550  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.42 
 
 		 758 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.64 
 
 		 757 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.71 
 
 		 756 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.66 
 
 		 741 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.8 
 
 		 747 aa  531  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.37 
 
 		 781 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.28 
 
 		 759 aa  512  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.97 
 
 		 750 aa  492  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  41.66 
 
 		 741 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.27 
 
 		 817 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.35 
 
 		 818 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  39.65 
 
 		 739 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.92 
 
 		 819 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.61 
 
 		 730 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.92 
 
 		 819 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.71 
 
 		 842 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.67 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.7 
 
 		 842 aa  425  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  37.21 
 
 		 818 aa  422  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.93 
 
 		 740 aa  415  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.89 
 
 		 786 aa  414  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.14 
 
 		 688 aa  412  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.83 
 
 		 818 aa  412  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.04 
 
 		 862 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.04 
 
 		 815 aa  409  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.64 
 
 		 685 aa  403  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.31 
 
 		 832 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.16 
 
 		 827 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.62 
 
 		 822 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.35 
 
 		 689 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.3 
 
 		 829 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.91 
 
 		 706 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.76 
 
 		 706 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.62 
 
 		 818 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.65 
 
 		 685 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.36 
 
 		 683 aa  402  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.56 
 
 		 827 aa  399  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.56 
 
 		 753 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3701  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.88 
 
 		 707 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.03 
 
 		 712 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.99 
 
 		 822 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.03 
 
 		 704 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.75 
 
 		 706 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.05 
 
 		 812 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0908  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.36 
 
 		 703 aa  392  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.09 
 
 		 704 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.51 
 
 		 846 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.91 
 
 		 815 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.89 
 
 		 704 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.22 
 
 		 846 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.43 
 
 		 818 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.27 
 
 		 700 aa  386  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.71 
 
 		 767 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.83 
 
 		 765 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.14 
 
 		 773 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.33 
 
 		 846 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.66 
 
 		 707 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.85 
 
 		 695 aa  389  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.93 
 
 		 717 aa  383  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.08 
 
 		 681 aa  385  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.72 
 
 		 779 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.89 
 
 		 682 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.59 
 
 		 702 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.1 
 
 		 818 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.81 
 
 		 678 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.43 
 
 		 682 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.76 
 
 		 686 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.3 
 
 		 689 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.9 
 
 		 679 aa  381  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  36 
 
 		 682 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  36 
 
 		 682 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  36 
 
 		 682 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1244  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.43 
 
 		 850 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.912337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  36 
 
 		 682 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.92 
 
 		 772 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>