More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4212 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1916  ATP-dependent DNA helicase RecG  71.3 
 
 
741 aa  1073    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.440344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.55 
 
 
752 aa  679    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5977  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.21 
 
 
733 aa  674    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.49 
 
 
733 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12988  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.23 
 
 
737 aa  921    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2116  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.43 
 
 
718 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.48597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1936  ATP-dependent DNA helicase RecG  71.3 
 
 
741 aa  1073    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510188  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4212  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
753 aa  1523    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192326  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1982  ATP-dependent DNA helicase RecG  71.3 
 
 
741 aa  1073    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2155  ATP-dependent DNA helicase RecG  83.95 
 
 
752 aa  1276    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.649606  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09240  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.34 
 
 
722 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0945523  normal  0.830238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3438  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.22 
 
 
736 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.936124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.74 
 
 
733 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.75 
 
 
733 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.21 
 
 
726 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1874  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.05 
 
 
760 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00557261  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8000  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.55 
 
 
723 aa  592  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552876  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1580  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.72 
 
 
741 aa  578  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8025  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.89 
 
 
746 aa  578  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3607  DEAD/DEAH box helicase-like  48.01 
 
 
739 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.33 
 
 
747 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.96 
 
 
778 aa  568  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.837627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2785  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.63 
 
 
725 aa  568  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.423247  normal  0.0848754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2279  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.42 
 
 
749 aa  555  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.349977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2304  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.39 
 
 
747 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.272394  hitchhiker  0.00347344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.45 
 
 
748 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205601  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3285  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.21 
 
 
750 aa  548  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.98 
 
 
757 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2510  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.2 
 
 
756 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11220  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.99 
 
 
758 aa  531  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.134358  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.53 
 
 
781 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0660561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10820  RecG-like helicase  44.28 
 
 
741 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0480832  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1368  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.76 
 
 
759 aa  508  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1674  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.97 
 
 
750 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00000586532  normal  0.0155467 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18430  RecG-like helicase  40.38 
 
 
739 aa  462  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08830  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.02 
 
 
730 aa  458  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.633208  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.48 
 
 
786 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.2 
 
 
818 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.72 
 
 
819 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1516  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.76 
 
 
720 aa  414  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3701  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.58 
 
 
707 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0517469  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.72 
 
 
819 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.52 
 
 
689 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.38 
 
 
681 aa  406  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.52 
 
 
817 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.77 
 
 
753 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  34.46 
 
 
818 aa  396  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.29 
 
 
704 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.08 
 
 
712 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.6 
 
 
740 aa  395  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.16 
 
 
703 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.42 
 
 
702 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.69 
 
 
818 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.55 
 
 
688 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.45 
 
 
842 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.28 
 
 
701 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.85 
 
 
685 aa  395  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.87 
 
 
689 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.59 
 
 
842 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.8 
 
 
827 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.8 
 
 
706 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.02 
 
 
700 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.55 
 
 
685 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.47 
 
 
818 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.63 
 
 
822 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.4 
 
 
706 aa  383  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.44 
 
 
846 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.01 
 
 
829 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4892  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.78 
 
 
706 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355865  normal  0.436875 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  34.93 
 
 
700 aa  382  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.15 
 
 
695 aa  383  1e-105  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.69 
 
 
832 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.79 
 
 
683 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.58 
 
 
846 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.56 
 
 
694 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.88 
 
 
812 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.59 
 
 
680 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.96 
 
 
862 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.34 
 
 
679 aa  380  1e-104  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.09 
 
 
779 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.22 
 
 
765 aa  379  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.29 
 
 
805 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.78 
 
 
815 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.59 
 
 
815 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.94 
 
 
846 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2477  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.79 
 
 
702 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0415356  normal  0.385274 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.79 
 
 
818 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.98 
 
 
781 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  34.51 
 
 
692 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.15 
 
 
679 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.62 
 
 
767 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.86 
 
 
737 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.85 
 
 
676 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.48 
 
 
827 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.97 
 
 
691 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.24 
 
 
706 aa  373  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.84 
 
 
701 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.84 
 
 
728 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  33.11 
 
 
818 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.95 
 
 
772 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>