18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3178 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3178  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 249 aa  510  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  42.17 
 
 		 706 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  34.92 
 
 		 706 aa  125  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  34.07 
 
 		 1065 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  34.07 
 
 		 1065 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  29.79 
 
 		 696 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  27.8 
 
 		 698 aa  112  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  29.39 
 
 		 707 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0451  DNA repair helicase  27.15 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000151647 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  25.1 
 
 		 732 aa  89.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 715 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  26.7 
 
 		 453 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  31.89 
 
 		 922 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  24.79 
 
 		 889 aa  62  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  25.13 
 
 		 924 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  25.13 
 
 		 928 aa  52  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  25.24 
 
 		 910 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  26.37 
 
 		 915 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>