More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1311 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
340 aa  694    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  39.08 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  38.15 
 
 
380 aa  156  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  30.45 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 
429 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  47.85 
 
 
603 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.85 
 
 
455 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.85 
 
 
455 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.68 
 
 
704 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.8 
 
 
701 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  35.13 
 
 
474 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  53.66 
 
 
135 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  54.1 
 
 
377 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  49.04 
 
 
461 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  54.92 
 
 
636 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  52.85 
 
 
130 aa  136  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  41.62 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  31.71 
 
 
458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  48.55 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.23 
 
 
426 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
469 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 
472 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
953 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 
498 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  43.29 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  53.33 
 
 
238 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 
255 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  46.15 
 
 
316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 
989 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
499 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  39.3 
 
 
352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.81 
 
 
989 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  44.58 
 
 
311 aa  125  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 
359 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
384 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.81 
 
 
376 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 
571 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.73 
 
 
591 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  47.97 
 
 
143 aa  123  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  47.24 
 
 
131 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  41.94 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.43 
 
 
701 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
373 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  48.78 
 
 
667 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  50.43 
 
 
182 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
263 aa  113  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  44 
 
 
126 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.13 
 
 
521 aa  113  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  45.08 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  45.3 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  45.24 
 
 
157 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.17 
 
 
817 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 
258 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
343 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  42.86 
 
 
134 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.84 
 
 
561 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  47.11 
 
 
127 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  43.8 
 
 
134 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.6 
 
 
245 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  43.33 
 
 
122 aa  104  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  39.1 
 
 
240 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  36.76 
 
 
265 aa  102  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36 
 
 
432 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  36.31 
 
 
261 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  40.5 
 
 
122 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.94 
 
 
194 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.98 
 
 
481 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  30.87 
 
 
273 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.59 
 
 
461 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.55 
 
 
197 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.22 
 
 
199 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 
248 aa  94  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
355 aa  93.2  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.6 
 
 
195 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.13 
 
 
191 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 
249 aa  92  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.32 
 
 
457 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.7 
 
 
199 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  39.17 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
154 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  40.6 
 
 
197 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  37.61 
 
 
798 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.77 
 
 
457 aa  90.1  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6068  response regulator receiver protein  40 
 
 
248 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  41.94 
 
 
204 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.98 
 
 
194 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.88 
 
 
635 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.44 
 
 
471 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.69 
 
 
651 aa  87.8  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.5 
 
 
200 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4330  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
127 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.86 
 
 
247 aa  86.7  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  40 
 
 
657 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1630  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.2 
 
 
243 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.29 
 
 
196 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  53.85 
 
 
753 aa  85.9  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  41.18 
 
 
153 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.59 
 
 
221 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>