282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0940 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  100 
 
 		 380 aa  786    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  54.47 
 
 		 386 aa  411  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  36.39 
 
 		 375 aa  226  6e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  35.66 
 
 		 372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  29.19 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  29.25 
 
 		 375 aa  99.4  9e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  29.6 
 
 		 372 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2554  metallophosphoesterase  28.21 
 
 		 515 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  27.39 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  26.8 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  27.87 
 
 		 399 aa  87  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  31.27 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  25.95 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  26.74 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  26.39 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  26.74 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  28.84 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  28.46 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  29.04 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  27.63 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  25.98 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  22.6 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  27.72 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  25.63 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  28.81 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  29.05 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  24.75 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  27.72 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  27.72 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  27.72 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  27.72 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  22.8 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  27.72 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  28.46 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  26.97 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  26.97 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  27.03 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  30.13 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.9 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  25.7 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  25.18 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  27.53 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  28.27 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  24.2 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  26.28 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  27.11 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  27.06 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  27.06 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  26.34 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  23.5 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  24.64 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  24.42 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  25.09 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  27.21 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  25.82 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  27.14 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  25.72 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.46 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  25.1 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  24.47 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.7 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  24.81 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  24.05 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  36.46 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  25.17 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  24.61 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  25.29 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  26.55 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  25.44 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  27.11 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  32.14 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  24.61 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  24.4 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  23.93 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  24.4 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  24.64 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  26.58 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  26.58 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  27.16 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  26.36 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  26.58 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.91 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0357  metallophosphoesterase  25.21 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.59 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.86 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  26.49 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  23.93 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  26.42 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  26.5 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  23.31 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.46 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  26.02 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  23.76 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  25.48 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  28 
 
 		 409 aa  59.7  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  24.83 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  28.62 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  32.61 
 
 		 776 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  25.58 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  22.05 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>