91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3359 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  75.17 
 
 
289 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  42.72 
 
 
307 aa  238  1e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  43.52 
 
 
301 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  40.4 
 
 
294 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  34.56 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  27.24 
 
 
321 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  27.18 
 
 
310 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.69 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  32.23 
 
 
367 aa  95.5  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  28.21 
 
 
359 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 
322 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  26.3 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.35 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.59 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.77 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.92 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.29 
 
 
354 aa  75.5  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0457  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  23.79 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  27.96 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2165  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.52 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  23.89 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.52 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  26.24 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1341  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  24.06 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207775  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  23.01 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  26.74 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
298 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  24.84 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0502  copper ABC transporter, permease protein  26.67 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  24.34 
 
 
278 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  23.04 
 
 
276 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  27.78 
 
 
278 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  25.5 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  23.81 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  24.73 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  24.73 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0491  copper ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  27.21 
 
 
322 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  28.24 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3868  copper ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1161  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  28 
 
 
332 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.171966  normal  0.284893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.92 
 
 
483 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  30.59 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  24.19 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 
319 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  24.88 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  25 
 
 
276 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  25.49 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  29.59 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0229  ABC transporter transmembrane protein  25.12 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  24.53 
 
 
276 aa  50.4  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  35.78 
 
 
279 aa  50.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  25.78 
 
 
265 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4063  putative NosY transmembrane protein  25.88 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621476  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4175  NosY transmembrane protein  25.88 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3993  copper ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  27.03 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1077  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  25.63 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3075  nitrous-oxide reductase, NosY component  22.03 
 
 
276 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  27.64 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 
313 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  31.37 
 
 
295 aa  47  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4216  nitrous oxide maturation protein NosY  26.97 
 
 
274 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 
272 aa  46.2  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04086  hypothetical protein  21.43 
 
 
475 aa  45.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  21.66 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  35.24 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3715  hypothetical protein  24.77 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  27.92 
 
 
943 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2016  copper ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 
280 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  25.27 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6011  copper ABC transporter, permease protein NosY  23.28 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  25.81 
 
 
914 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  25.54 
 
 
273 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  27.46 
 
 
912 aa  42.4  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>