More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1312 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  54.53 
 
 
1037 aa  1121    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1046 aa  2150    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  38 
 
 
1043 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  24.77 
 
 
963 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  26.97 
 
 
1065 aa  184  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  26.97 
 
 
1065 aa  184  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  29.03 
 
 
972 aa  182  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  27.56 
 
 
921 aa  179  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
941 aa  177  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
941 aa  177  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  27.51 
 
 
578 aa  171  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  27.91 
 
 
915 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  27.75 
 
 
916 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  27.75 
 
 
915 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.19 
 
 
1167 aa  168  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  27.54 
 
 
949 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  29.19 
 
 
961 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  27.16 
 
 
572 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.88 
 
 
1167 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  26.7 
 
 
942 aa  166  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  29.32 
 
 
1170 aa  164  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  26.38 
 
 
584 aa  164  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  26.55 
 
 
584 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  28.1 
 
 
947 aa  162  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  27.6 
 
 
963 aa  162  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.8 
 
 
1144 aa  159  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  26.86 
 
 
1057 aa  158  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.4 
 
 
835 aa  158  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  26.85 
 
 
932 aa  155  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  27.06 
 
 
1031 aa  154  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  26.14 
 
 
467 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.12 
 
 
1145 aa  141  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  27.89 
 
 
968 aa  141  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  26.63 
 
 
968 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  25.73 
 
 
969 aa  135  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  28.73 
 
 
968 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  26.52 
 
 
929 aa  134  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.58 
 
 
1170 aa  133  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  24.92 
 
 
889 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  24.59 
 
 
975 aa  131  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  27.07 
 
 
969 aa  131  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  32.54 
 
 
969 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  32.16 
 
 
1170 aa  129  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  26.1 
 
 
969 aa  127  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  30.96 
 
 
1169 aa  125  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.95 
 
 
1169 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  26.21 
 
 
988 aa  122  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  34.78 
 
 
1167 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  30.42 
 
 
1160 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.62 
 
 
969 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  24.96 
 
 
968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  24.62 
 
 
967 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  24.96 
 
 
968 aa  120  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  25.04 
 
 
971 aa  119  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  24.79 
 
 
968 aa  119  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  32.91 
 
 
760 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  30.69 
 
 
964 aa  118  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  36.48 
 
 
560 aa  118  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  36.48 
 
 
560 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  36.48 
 
 
560 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  36.48 
 
 
560 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  36.48 
 
 
560 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  36.48 
 
 
560 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  36.48 
 
 
560 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  36.48 
 
 
560 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.23 
 
 
933 aa  118  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  40 
 
 
560 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  24.23 
 
 
967 aa  117  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  30.91 
 
 
1172 aa  117  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  37.34 
 
 
669 aa  117  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.29 
 
 
962 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  39.29 
 
 
560 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30.16 
 
 
1160 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  33.49 
 
 
1194 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  38.71 
 
 
1129 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  37.57 
 
 
906 aa  116  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  35.85 
 
 
560 aa  115  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  34.34 
 
 
975 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  28.24 
 
 
1172 aa  114  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  34.02 
 
 
966 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  25.77 
 
 
924 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  32.06 
 
 
1170 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  33.33 
 
 
927 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  32.8 
 
 
1116 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.78 
 
 
1212 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  38.85 
 
 
774 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.62 
 
 
1168 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  27.3 
 
 
555 aa  111  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  31.74 
 
 
922 aa  111  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  32.41 
 
 
925 aa  110  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  24.6 
 
 
1052 aa  109  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  35.79 
 
 
829 aa  109  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  35.94 
 
 
1147 aa  109  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  37.41 
 
 
554 aa  109  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  33.73 
 
 
967 aa  108  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.74 
 
 
966 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  35.71 
 
 
1044 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  35.24 
 
 
1038 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  35.88 
 
 
1137 aa  105  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  37.2 
 
 
1136 aa  105  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>