More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0625 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  82.94 
 
 		 968 aa  1684    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  56.7 
 
 		 968 aa  1161    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  56.7 
 
 		 968 aa  1161    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  56.49 
 
 		 968 aa  1160    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  48.29 
 
 		 948 aa  889    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  40.47 
 
 		 960 aa  654    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  46 
 
 		 949 aa  815    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  58.85 
 
 		 969 aa  1220    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  56.13 
 
 		 944 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  89.36 
 
 		 968 aa  1805    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  50.31 
 
 		 948 aa  912    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  52.09 
 
 		 975 aa  1012    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  82.52 
 
 		 968 aa  1671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  38.11 
 
 		 982 aa  652    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  48.81 
 
 		 948 aa  895    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  56.7 
 
 		 968 aa  1162    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  56.7 
 
 		 968 aa  1161    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  48.76 
 
 		 948 aa  900    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  42.79 
 
 		 958 aa  803    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  42.79 
 
 		 958 aa  802    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  48.92 
 
 		 948 aa  900    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  41.6 
 
 		 982 aa  717    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  56.19 
 
 		 968 aa  1145    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  48.66 
 
 		 948 aa  896    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  48.5 
 
 		 948 aa  892    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  56.19 
 
 		 968 aa  1145    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  83.04 
 
 		 968 aa  1688    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  55.83 
 
 		 967 aa  1137    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  83.25 
 
 		 968 aa  1686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  49.33 
 
 		 948 aa  906    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  56.7 
 
 		 968 aa  1160    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  48 
 
 		 947 aa  886    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  57.11 
 
 		 968 aa  1166    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  56.7 
 
 		 968 aa  1161    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  57.07 
 
 		 967 aa  1150    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  56.7 
 
 		 968 aa  1162    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  85.02 
 
 		 968 aa  1710    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  83.04 
 
 		 968 aa  1688    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  82.32 
 
 		 968 aa  1663    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  43.79 
 
 		 980 aa  751    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  56.29 
 
 		 968 aa  1154    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  41.33 
 
 		 1028 aa  717    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  56.24 
 
 		 967 aa  1141    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  82.94 
 
 		 968 aa  1686    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  48.34 
 
 		 943 aa  912    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  56.7 
 
 		 968 aa  1162    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  86.05 
 
 		 968 aa  1748    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  49.54 
 
 		 966 aa  938    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  82.11 
 
 		 968 aa  1670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  82.32 
 
 		 968 aa  1673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  58.74 
 
 		 969 aa  1186    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  82.52 
 
 		 968 aa  1674    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  50.1 
 
 		 950 aa  912    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  56.35 
 
 		 967 aa  1149    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  82.11 
 
 		 968 aa  1671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  48.76 
 
 		 949 aa  896    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  59.55 
 
 		 969 aa  1235    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  58.41 
 
 		 969 aa  1194    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  57.11 
 
 		 968 aa  1166    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  100 
 
 		 968 aa  1993    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  56.08 
 
 		 968 aa  1145    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  77.77 
 
 		 967 aa  1544    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  45.93 
 
 		 947 aa  850    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  55.76 
 
 		 970 aa  1130    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  57.11 
 
 		 968 aa  1166    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  55.7 
 
 		 919 aa  1078    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  57.01 
 
 		 968 aa  1164    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  42.36 
 
 		 953 aa  753    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  36.89 
 
 		 942 aa  590  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  35.02 
 
 		 874 aa  534  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  28.49 
 
 		 905 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  28.25 
 
 		 892 aa  210  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  28.37 
 
 		 898 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  27.46 
 
 		 898 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  28.62 
 
 		 578 aa  160  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  26.8 
 
 		 560 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.95 
 
 		 555 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  26.12 
 
 		 669 aa  145  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.42 
 
 		 584 aa  144  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  26.89 
 
 		 560 aa  144  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  26.89 
 
 		 560 aa  144  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  26.72 
 
 		 554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.29 
 
 		 584 aa  135  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  29.11 
 
 		 919 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  26.81 
 
 		 1168 aa  135  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  27.75 
 
 		 1037 aa  131  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  28.36 
 
 		 1046 aa  126  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  25.5 
 
 		 572 aa  125  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  31.77 
 
 		 988 aa  124  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  24.58 
 
 		 467 aa  120  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  36.36 
 
 		 1094 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  31.88 
 
 		 925 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  31.82 
 
 		 1065 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  31.82 
 
 		 1065 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  32.53 
 
 		 922 aa  118  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  35.56 
 
 		 927 aa  118  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  25.48 
 
 		 954 aa  115  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  35.05 
 
 		 900 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  27.59 
 
 		 1201 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 1201 aa  113  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>