More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3820 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  81.92 
 
 		 968 aa  1655    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  75.93 
 
 		 968 aa  1557    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  75.93 
 
 		 968 aa  1557    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  56.86 
 
 		 968 aa  1165    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  53.27 
 
 		 948 aa  946    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  56.76 
 
 		 968 aa  1162    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  47.05 
 
 		 949 aa  802    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  85.21 
 
 		 967 aa  1708    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  100 
 
 		 967 aa  1977    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  83.06 
 
 		 968 aa  1669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  50.81 
 
 		 975 aa  985    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  56.35 
 
 		 968 aa  1147    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  81.82 
 
 		 968 aa  1654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  97.93 
 
 		 967 aa  1944    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  52.29 
 
 		 948 aa  941    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  39.36 
 
 		 982 aa  654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  75.83 
 
 		 968 aa  1554    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  63.16 
 
 		 969 aa  1273    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  43.02 
 
 		 958 aa  818    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  43.22 
 
 		 958 aa  823    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  51.67 
 
 		 948 aa  937    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  41.62 
 
 		 982 aa  682    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  56.76 
 
 		 968 aa  1165    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  52.81 
 
 		 948 aa  943    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  53.06 
 
 		 948 aa  944    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  81.92 
 
 		 968 aa  1655    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  62.23 
 
 		 969 aa  1255    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  75.83 
 
 		 968 aa  1556    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  76.14 
 
 		 968 aa  1552    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  75.53 
 
 		 944 aa  1501    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  52.75 
 
 		 948 aa  943    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  56.55 
 
 		 968 aa  1143    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  62.33 
 
 		 969 aa  1275    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  84.69 
 
 		 967 aa  1706    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  75.93 
 
 		 968 aa  1557    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  76.14 
 
 		 968 aa  1552    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  55.83 
 
 		 968 aa  1137    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  55.93 
 
 		 968 aa  1127    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  44.34 
 
 		 953 aa  786    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  45.53 
 
 		 980 aa  759    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  52.8 
 
 		 949 aa  931    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  56.39 
 
 		 968 aa  1148    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  75.93 
 
 		 968 aa  1557    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  41.79 
 
 		 1028 aa  684    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  55.93 
 
 		 968 aa  1149    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  47.35 
 
 		 943 aa  892    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  45.92 
 
 		 947 aa  852    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  56.33 
 
 		 966 aa  1078    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  56.66 
 
 		 968 aa  1156    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  56.76 
 
 		 968 aa  1157    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  76.03 
 
 		 968 aa  1549    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  56.04 
 
 		 968 aa  1147    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  53.12 
 
 		 950 aa  951    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  76.14 
 
 		 968 aa  1552    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  52.91 
 
 		 948 aa  949    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  55.82 
 
 		 968 aa  1127    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  56.76 
 
 		 968 aa  1156    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  75.41 
 
 		 919 aa  1464    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  56.86 
 
 		 968 aa  1165    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  52.91 
 
 		 947 aa  943    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  62.85 
 
 		 969 aa  1275    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  41.5 
 
 		 960 aa  643    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  75.93 
 
 		 968 aa  1556    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  55.83 
 
 		 967 aa  1124    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  53.22 
 
 		 948 aa  945    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  55.57 
 
 		 970 aa  1115    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  76.03 
 
 		 968 aa  1558    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  76.86 
 
 		 968 aa  1563    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  38.09 
 
 		 942 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  36.48 
 
 		 874 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  28.9 
 
 		 905 aa  210  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  28.2 
 
 		 892 aa  190  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  27.7 
 
 		 898 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  30.52 
 
 		 898 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.56 
 
 		 941 aa  163  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.56 
 
 		 941 aa  163  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.13 
 
 		 555 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1144 aa  141  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.83 
 
 		 835 aa  141  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.73 
 
 		 900 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  25.3 
 
 		 554 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.59 
 
 		 1201 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.59 
 
 		 1201 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  29.75 
 
 		 1165 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.35 
 
 		 584 aa  133  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  23.57 
 
 		 1138 aa  128  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.34 
 
 		 584 aa  127  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  34.85 
 
 		 988 aa  126  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  24.72 
 
 		 669 aa  125  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  27.54 
 
 		 1031 aa  122  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  26.38 
 
 		 572 aa  122  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  27.74 
 
 		 1046 aa  121  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.51 
 
 		 1045 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.72 
 
 		 1013 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  25.7 
 
 		 952 aa  114  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  25.9 
 
 		 952 aa  114  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  25.9 
 
 		 952 aa  114  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  25.47 
 
 		 982 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  30.92 
 
 		 925 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  34.22 
 
 		 1065 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>