206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1126 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  29.85 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  26.61 
 
 		 380 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  26.83 
 
 		 356 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  28.45 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  26.14 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  26.51 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  26.51 
 
 		 361 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  27.74 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  26.8 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  29.57 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2719  cytoskeletal protein RodZ  29.08 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2676  cytoskeletal protein RodZ  28.53 
 
 		 334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  28.53 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2782  cytoskeletal protein RodZ  28.53 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  26.07 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  29.14 
 
 		 340 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2668  cytoskeletal protein RodZ  27.46 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.248516 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  27.98 
 
 		 345 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  28.82 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2800  cytoskeletal protein RodZ  28.77 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.563257  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.07 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02408  hypothetical protein  28.49 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1152  transcriptional regulator, XRE family  28.49 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.603159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1161  cytoskeletal protein RodZ  28.49 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.697985  decreased coverage  0.00885076 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2667  cytoskeletal protein RodZ  28.49 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2891  cytoskeletal protein RodZ  28.49 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02370  hypothetical protein  28.49 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2763  cytoskeletal protein RodZ  29.25 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3741  cytoskeletal protein RodZ  28.49 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  27.78 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  29.78 
 
 		 393 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1257  cytoskeletal protein RodZ  26.72 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  27.63 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0728  hypothetical protein  26.75 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1185  cytoskeletal protein RodZ  24.71 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  27.41 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  27.22 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  25.97 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  25.97 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  25.6 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  25.89 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  26.1 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1058  transcriptional regulator, XRE family  25.61 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0971616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1150  transcriptional regulator, XRE family  27.47 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1433  hypothetical protein  23.17 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  24.18 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1355  hypothetical protein  19.51 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000155612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  36.84 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  23.67 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  33.8 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  24.01 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  24.01 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1255  hypothetical protein  40.48 
 
 		 364 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0157671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3015  cytoskeletal protein RodZ  33.61 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  22.05 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  26.35 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2036  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0080217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  38.16 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1292  cytoskeletal protein RodZ  31.09 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  36.62 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  32.81 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  32.56 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3127  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1214  hypothetical protein  41.54 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  37.88 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  27.45 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  30.7 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  32 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  30.46 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  33.7 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  32 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 279 aa  57  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  36 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2378  hypothetical protein  37.33 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.654277  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  31.63 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  36 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1346  hypothetical protein  34.48 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2356  hypothetical protein  34.48 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  27.05 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1778  hypothetical protein  34.21 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.842722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1714  hypothetical protein  34.21 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.333106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  22.71 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1836  hypothetical protein  34.48 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2229  hypothetical protein  34.48 
 
 		 336 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0169473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 298 aa  55.8  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0061  hypothetical protein  34.48 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0231937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2191  hypothetical protein  34.48 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.452713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1108  hypothetical protein  34.48 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148526  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1738  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>