More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1122 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1122  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 
250 aa  502  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0327  tryptophan synthase subunit alpha  61.07 
 
 
259 aa  323  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1657  tryptophan synthase subunit alpha  59.84 
 
 
258 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.58592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0244  tryptophan synthase subunit alpha  59.84 
 
 
259 aa  318  7e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0592  tryptophan synthase subunit alpha  59.84 
 
 
259 aa  315  4e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  44.94 
 
 
302 aa  220  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  44.94 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  48.99 
 
 
263 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  46.29 
 
 
268 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  43.95 
 
 
268 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  43.67 
 
 
266 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  41.94 
 
 
268 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  43.44 
 
 
274 aa  198  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1463  tryptophan synthase subunit alpha  40.74 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.467538  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 
274 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  44.64 
 
 
265 aa  195  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 
269 aa  194  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  41.53 
 
 
269 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  42.62 
 
 
259 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4493  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 
265 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19226  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  43.64 
 
 
266 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1171  tryptophan synthase subunit alpha  42.02 
 
 
279 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  39.84 
 
 
272 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  43.21 
 
 
259 aa  191  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  40.71 
 
 
266 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4942  tryptophan synthase subunit alpha  41.3 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0553519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  41.56 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  41.94 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  41.94 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  40.73 
 
 
269 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  41.77 
 
 
256 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  40.73 
 
 
269 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  40.32 
 
 
269 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  42.17 
 
 
256 aa  188  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 
270 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  46.19 
 
 
279 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  42.79 
 
 
275 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  43.69 
 
 
280 aa  185  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  41.46 
 
 
265 aa  184  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3037  tryptophan synthase subunit alpha  40.08 
 
 
276 aa  184  9e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.366076  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  38.14 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 
269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  42.79 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  38.4 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  45.74 
 
 
279 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  44.64 
 
 
268 aa  182  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  41.87 
 
 
266 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  41.46 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  38.55 
 
 
267 aa  182  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0481  tryptophan synthase subunit alpha  39.83 
 
 
271 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  41.82 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  40.76 
 
 
263 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  40.76 
 
 
263 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  45.29 
 
 
279 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  40.76 
 
 
263 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  42.34 
 
 
271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2816  tryptophan synthase, alpha subunit  41.27 
 
 
296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  40.17 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1828  tryptophan synthase, alpha subunit  39.33 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  43.24 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  39.04 
 
 
279 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 
265 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  40.24 
 
 
262 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 
272 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 
272 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  40.97 
 
 
272 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  43.81 
 
 
700 aa  177  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  40.43 
 
 
278 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  40.79 
 
 
271 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  44.55 
 
 
279 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  40 
 
 
263 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  40.32 
 
 
267 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  41.23 
 
 
264 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  42.79 
 
 
265 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  39.74 
 
 
278 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  41.3 
 
 
278 aa  175  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  37.15 
 
 
278 aa  175  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1249  tryptophan synthase subunit alpha  40.16 
 
 
262 aa  175  6e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0254  tryptophan synthase, alpha subunit  37.96 
 
 
267 aa  175  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00170979  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0319  tryptophan synthase subunit alpha  43.17 
 
 
254 aa  174  8e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1273  tryptophan synthase subunit alpha  38.95 
 
 
304 aa  174  8e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  38.25 
 
 
277 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  36.69 
 
 
265 aa  174  9e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  41.18 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  40.32 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  39.46 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1255  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00504507  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  39.53 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1308  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 
267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000519792  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  40.87 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  37.5 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  39.57 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  39.18 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3842  tryptophan synthase, alpha subunit  42.41 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  38.21 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  37.96 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  37.1 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>