More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0621 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
900 aa  668    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 
892 aa  1242    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
924 aa  708    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 
892 aa  1287    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 
892 aa  673    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  68.65 
 
 
892 aa  1290    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
923 aa  775    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
925 aa  688    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
913 aa  750    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
899 aa  651    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  68.32 
 
 
892 aa  1285    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
913 aa  749    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
882 aa  694    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
916 aa  745    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 
896 aa  690    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
923 aa  785    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 
914 aa  753    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
926 aa  722    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
926 aa  724    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
892 aa  692    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
926 aa  719    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 
913 aa  789    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
915 aa  731    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
904 aa  641    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 
892 aa  677    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
910 aa  1857    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
907 aa  592  1e-168  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
889 aa  535  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 
876 aa  287  5.999999999999999e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  28.74 
 
 
867 aa  283  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 
863 aa  280  7e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
859 aa  279  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
874 aa  277  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
876 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  27.17 
 
 
878 aa  273  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 
863 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
883 aa  270  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  28 
 
 
870 aa  269  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 
878 aa  270  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 
878 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
876 aa  263  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 
879 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 
882 aa  262  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
880 aa  261  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 
880 aa  261  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1887  alanyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
872 aa  259  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 
880 aa  258  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
880 aa  257  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  26.27 
 
 
877 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 
889 aa  255  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  25.72 
 
 
889 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 
860 aa  254  7e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
878 aa  253  8.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  25.6 
 
 
882 aa  253  1e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 
865 aa  252  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  26.2 
 
 
874 aa  252  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
875 aa  252  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 
876 aa  251  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 
860 aa  250  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  25.39 
 
 
878 aa  250  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
876 aa  250  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  26.65 
 
 
876 aa  250  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  25.38 
 
 
865 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
863 aa  250  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 
878 aa  250  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 
891 aa  249  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  24.13 
 
 
865 aa  249  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 
887 aa  248  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 
879 aa  248  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 
880 aa  248  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 
879 aa  248  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  25.14 
 
 
891 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
891 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 
879 aa  247  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  26.12 
 
 
884 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  24.89 
 
 
889 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0862  alanyl-tRNA synthetase  26.52 
 
 
877 aa  245  1.9999999999999999e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.74806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  26.31 
 
 
880 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  26.31 
 
 
880 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  26 
 
 
888 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  25.22 
 
 
874 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  24.86 
 
 
876 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 
880 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0810  alanyl-tRNA synthetase  25.64 
 
 
872 aa  245  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  25.45 
 
 
886 aa  245  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 
876 aa  245  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0728  alanyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 
880 aa  245  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00762442  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1164  alanyl-tRNA synthetase  25.11 
 
 
885 aa  245  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.855181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
880 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 
864 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  26.17 
 
 
848 aa  244  3.9999999999999997e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4468  alanyl-tRNA synthetase  26.31 
 
 
880 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 
876 aa  244  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  24.92 
 
 
885 aa  244  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  26.31 
 
 
880 aa  244  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4521  alanyl-tRNA synthetase  26.31 
 
 
880 aa  244  5e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00304935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  24 
 
 
892 aa  244  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0883  alanyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 
865 aa  244  6e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000818492  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0877  alanyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 
879 aa  244  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.438968 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  25.96 
 
 
886 aa  244  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>