68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2491 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2491  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  512  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.687072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1619  Sporulation domain protein  28.57 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.17908  normal  0.957178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2740  sporulation domain-containing protein  27.96 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2834  sporulation domain-containing protein  27.74 
 
 
250 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0238202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2757  sporulation domain-containing protein  27.74 
 
 
250 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2439  sporulation domain-containing protein  28.99 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.855765  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1619  sporulation domain-containing protein  25.83 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1428  sporulation domain-containing protein  29.17 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1493  sporulation domain-containing protein  28.06 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3066  hypothetical protein  29.62 
 
 
281 aa  72  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0959  cell division related protein  26.05 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.128366  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1481  sporulation domain-containing protein  28.52 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.896117 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1052  sporulation and cell division repeat-containing protein  26.05 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1607  sporulation related  28.68 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1488  sporulation related  27.31 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000050806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2148  sporulation related  26.22 
 
 
223 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.891336  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1265  sporulation related  30.57 
 
 
221 aa  62  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.96863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03097  hypothetical protein  25.47 
 
 
197 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1297  hypothetical protein  25.58 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1694  sporulation related  26.05 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1296  hypothetical protein  26.35 
 
 
256 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1155  Sporulation domain protein  33.75 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.745812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002877  DedD protein  26.32 
 
 
197 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.936612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2304  sporulation domain-containing protein  24.72 
 
 
221 aa  55.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1240  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 
228 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.873348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01208  dedD protein  31.33 
 
 
203 aa  53.5  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0776  sporulation domain-containing protein  26.25 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000153449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0523  dedD protein  24.81 
 
 
198 aa  52.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0155221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1424  hypothetical protein  26.67 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0357  hypothetical protein  26.67 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2594  hypothetical protein  25.65 
 
 
224 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1800  sporulation domain-containing protein  39.19 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1654  sporulation domain-containing protein  31.71 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1533  hypothetical protein  26.12 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0478054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1372  Sporulation domain protein  28.14 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1673  hypothetical protein  25.69 
 
 
168 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.559277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2023  hypothetical protein  47.54 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23890  hypothetical protein  47.54 
 
 
215 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0214364  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0810  Sporulation domain protein  36.49 
 
 
346 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.165311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2046  sporulation domain-containing protein  27.87 
 
 
186 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2572  Sporulation domain protein  25.26 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1554  sporulation domain-containing protein  80 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0901  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1605  sporulation related  28.06 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1758  hypothetical protein  33.73 
 
 
424 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2863  hypothetical protein  24.63 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1559  sporulation domain-containing protein  41.18 
 
 
221 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331959  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1078  putative sporulation and cell division protein  34.18 
 
 
189 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1257  Sporulation domain protein  67.86 
 
 
218 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1967  sporulation domain-containing protein  21.85 
 
 
205 aa  46.6  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2075  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.71 
 
 
174 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1639  sporulation repeat-containing protein  30.53 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3800  dedD protein  23.13 
 
 
204 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1998  sporulation domain protein  43.33 
 
 
214 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356998  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1532  sporulation domain-containing protein  42.62 
 
 
216 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3763  sporulation domain-containing protein  43.33 
 
 
214 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1900  argininosuccinate synthase  60 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3497  sporulation domain-containing protein  33.72 
 
 
352 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1025  hypothetical protein  73.08 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.469684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1666  sporulation related  33.33 
 
 
217 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1397  sporulation domain-containing protein  46.67 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2982  sporulation domain-containing protein  38.36 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00537786  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2713  sporulation domain-containing protein  66.67 
 
 
204 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1090  sporulation domain-containing protein  33.85 
 
 
332 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.438244 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2796  hypothetical protein  40.35 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3813  hypothetical protein  59.26 
 
 
216 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02506  hypothetical protein  31.43 
 
 
345 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  30.67 
 
 
194 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>