259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03565 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03565  permease  100 
 
 		 391 aa  791    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  46.31 
 
 		 433 aa  345  7e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  45.06 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  47.11 
 
 		 365 aa  320  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  40.04 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  42.25 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  39.92 
 
 		 490 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  38.57 
 
 		 497 aa  280  3e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  52.56 
 
 		 366 aa  277  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  42.3 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  38.97 
 
 		 402 aa  250  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  37.91 
 
 		 451 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  36.51 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  42.06 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  38.58 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  36.41 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  37.82 
 
 		 367 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  34.84 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  35.64 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0471  permease  37.06 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  41.28 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  40.62 
 
 		 362 aa  211  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  40.95 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  43.14 
 
 		 510 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  40.15 
 
 		 511 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  39.29 
 
 		 509 aa  179  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  39.71 
 
 		 503 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  57.22 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  40.22 
 
 		 513 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  39.42 
 
 		 500 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  55.14 
 
 		 491 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  52.66 
 
 		 496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  50.93 
 
 		 501 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  30.91 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  32.1 
 
 		 620 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  27.19 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0665  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF318 domain protein)  24.78 
 
 		 324 aa  100  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  26.77 
 
 		 343 aa  92.8  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1730  permease, putative  23.38 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.157468  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05267  hypothetical protein  21.87 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  25.23 
 
 		 345 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  23.75 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  24.81 
 
 		 343 aa  84  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  24.75 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  23.65 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  25.47 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  25.3 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  25.3 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  25.3 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1506  permease  25.82 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1479  permease  25.82 
 
 		 343 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  25.23 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  24.23 
 
 		 714 aa  80.9  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  25.89 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0563  permease  23.24 
 
 		 633 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  26.97 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  25 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  24.25 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3823  permease  23.01 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2338  permease  23.01 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.677868  normal  0.0877008 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  26.1 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4946  permease  26.51 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3208  permease  23.51 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.757693  normal  0.643119 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0456  permease  24.92 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.349904  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0820  hypothetical protein  23.48 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0729  ABC transporter, permease protein, putative  21.24 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  24.84 
 
 		 306 aa  76.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  25.09 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  21.05 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0785  hypothetical protein  25.15 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000784162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  21.51 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  23.23 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  25.09 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  25.63 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  24.16 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  24.85 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  24.73 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  24.2 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0714  permease  21.5 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.846704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3859  permease  25.54 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210987  normal  0.0366228 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1323  permease  23.72 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2072  permease  23.72 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2907  hypothetical protein  22.12 
 
 		 611 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  22.02 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  23.81 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  25.55 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  24.91 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  25.45 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1544  hypothetical protein  26.52 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000224631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  23.4 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3932  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  24.58 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  24.91 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  23.38 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  25.72 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0379  permease  21.32 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  22.7 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  25.08 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  23.93 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  21.97 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0016  hypothetical protein  24.32 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>