More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03499 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  49.54 
 
 		 1071 aa  1080    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  50.14 
 
 		 1062 aa  1081    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  48.42 
 
 		 1069 aa  1068    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  48.96 
 
 		 1049 aa  1059    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  48.51 
 
 		 1067 aa  1063    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  42.58 
 
 		 1084 aa  901    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  47.71 
 
 		 1138 aa  1056    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  48.21 
 
 		 1065 aa  1053    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  50.23 
 
 		 1062 aa  1080    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  49.36 
 
 		 1081 aa  1071    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  50.43 
 
 		 1066 aa  1077    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  100 
 
 		 1111 aa  2294    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  42.56 
 
 		 1078 aa  887    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  68.52 
 
 		 1113 aa  1637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  49.04 
 
 		 1062 aa  1080    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  48.65 
 
 		 1062 aa  1071    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  48.65 
 
 		 1062 aa  1070    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  48.67 
 
 		 1060 aa  1069    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  43.98 
 
 		 1062 aa  942    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  49.95 
 
 		 1062 aa  1077    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  53.92 
 
 		 598 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  49.26 
 
 		 1062 aa  1074    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  48.47 
 
 		 1062 aa  1066    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  44.32 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  26.99 
 
 		 1052 aa  351  4e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.61 
 
 		 1005 aa  188  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1042 aa  179  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  23.9 
 
 		 1040 aa  177  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  23.88 
 
 		 1042 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  23.94 
 
 		 1059 aa  172  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  24.3 
 
 		 1014 aa  168  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  24.08 
 
 		 1031 aa  160  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.71 
 
 		 666 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  21.89 
 
 		 1010 aa  107  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  26.9 
 
 		 568 aa  97.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.94 
 
 		 430 aa  90.1  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  23.89 
 
 		 672 aa  84.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  25.19 
 
 		 438 aa  83.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  24 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  24.94 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  23.93 
 
 		 1067 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1561  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 375 aa  80.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  25 
 
 		 438 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.33 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.59 
 
 		 969 aa  78.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  26.09 
 
 		 409 aa  77  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  22.73 
 
 		 543 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  30.77 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  22.42 
 
 		 496 aa  76.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  28.36 
 
 		 717 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.72 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  29.06 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25.79 
 
 		 1193 aa  74.7  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 431 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 433 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 463 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 463 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 430 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 433 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 430 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  29.38 
 
 		 432 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  26.49 
 
 		 567 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  23.5 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  24.57 
 
 		 692 aa  72.8  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  23.45 
 
 		 1167 aa  72.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  36.36 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  26.75 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  24.15 
 
 		 485 aa  72  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  36.36 
 
 		 434 aa  72  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  30.59 
 
 		 446 aa  72  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  23.08 
 
 		 433 aa  72  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  24.43 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  29.81 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  36.36 
 
 		 434 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  23 
 
 		 819 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  26.85 
 
 		 431 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  23.32 
 
 		 459 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  23.42 
 
 		 470 aa  71.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 642 aa  70.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  23.22 
 
 		 478 aa  70.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  29.59 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  26.39 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  30.59 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  23.72 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.46 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  21.57 
 
 		 590 aa  69.3  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.7 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.65 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  26.39 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  22.86 
 
 		 1090 aa  68.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  23.61 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  26.39 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  28.31 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  26.39 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.49 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0857  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.2 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.04 
 
 		 1082 aa  68.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  29.22 
 
 		 436 aa  67.4  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.14 
 
 		 444 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  29.45 
 
 		 445 aa  67.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>