More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5455 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  461  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1191  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.97 
 
 
244 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.55 
 
 
244 aa  296  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  0.112412 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.76 
 
 
248 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
233 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.426807 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  39.75 
 
 
232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.61 
 
 
230 aa  149  6e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
245 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
249 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13982  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0291  hypothetical protein  32.92 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4730  putative short-chain dehydrogenases/reductases (SDR) family protein  40.08 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0264  hypothetical protein  32.93 
 
 
232 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0259  hypothetical protein  34.16 
 
 
232 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  34.14 
 
 
247 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.89 
 
 
250 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
250 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027964 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
250 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
256 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
257 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
260 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
262 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000350545  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
262 aa  99  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
257 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.650053 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.442854  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  33.06 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
255 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185948  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09158  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01040)  32 
 
 
251 aa  95.5  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 
250 aa  95.1  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
256 aa  95.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
255 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.199031 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
263 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  30.71 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0380  ATPase  31.84 
 
 
246 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.647768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
233 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13520  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
314 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0292785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
250 aa  92.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1515  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303752  normal  0.752518 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
285 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
237 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.138862 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
262 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0512455  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0160173  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.82 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2584  ketoreductase  34.07 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218659  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  0.0943454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.2 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.147758  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07016  oxidoreductase  29.46 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1551  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
282 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489545  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5253  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
250 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2070  hypothetical protein  27.87 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34089  predicted protein  28.22 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
287 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 
248 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.21 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 
250 aa  89  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.443482  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 
254 aa  89  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
257 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.30491  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
233 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
257 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.429705  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2437  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.27 
 
 
251 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.090617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
250 aa  89  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.27381  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
269 aa  88.6  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1363  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.46 
 
 
263 aa  88.6  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
250 aa  88.6  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.228128  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2080  hypothetical protein  27.46 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1569  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241614  normal  0.724417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>