More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1210 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1210  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2977  secretion protein HlyD  65.81 
 
 		 313 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3414  RND family efflux transporter MFP subunit  64.54 
 
 		 313 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.100509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3252  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4040  secretion protein HlyD family protein  30.71 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3096  secretion protein HlyD family protein  30.05 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3193  secretion protein HlyD family protein  30.05 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.252667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3016  secretion protein HlyD family protein  29.79 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4620  putative membrane fusion protein of efflux pump HlyD family v  29.32 
 
 		 392 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3790  membrane fusion protein family protein  30.89 
 
 		 378 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0123  secretion protein HlyD family protein  30.63 
 
 		 378 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05111  hypothetical protein  30.91 
 
 		 376 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0127  secretion protein HlyD family protein  30.63 
 
 		 378 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4082  membrane fusion protein family protein  30.63 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3911  membrane fusion protein family protein  30.63 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3603  HlyD family secretion protein  30.83 
 
 		 378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0088  hypothetical protein  29.84 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000928582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03441  membrane fusion protein (MFP) component of efflux pump, signal anchor  30.37 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03392  hypothetical protein  30.37 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4954  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  30.37 
 
 		 378 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2518  secretion protein HlyD  31.4 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.554546  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1024  secretion protein HlyD family protein  29.97 
 
 		 378 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.524783  normal  0.0152153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0890  secretion protein HlyD family protein  29.44 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0434  secretion protein, HlyD family  31.82 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03452  hypothetical protein  28 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4095  membrane fusion protein family protein  28 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.557527  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0109  secretion protein HlyD family protein  28 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03403  hypothetical protein  28 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3930  auxiliary membrane fusion protein family transporter  28 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.954749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0138  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0873  secretion protein HlyD family protein  32.11 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0115  secretion protein HlyD family protein  28 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0435233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3803  membrane fusion protein family protein  28 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.456542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4967  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28 
 
 		 378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001244  multidrug resistance efflux pump  29.3 
 
 		 376 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0975  secretion protein HlyD family protein  29.18 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000270967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3899  secretion protein HlyD family protein  27.44 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4014  auxiliary transport protein, membrane fusion protein family  27.47 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2805  HlyD family secretion protein  28 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.743395 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3298  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1061  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1094  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0115  secretion protein HlyD family protein  28.35 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0991  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 381 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  29.46 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  29.46 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  29.46 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  31.97 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  29.05 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.05 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  30.45 
 
 		 365 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.63 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  28.63 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  28.63 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.22 
 
 		 285 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4935  RND family efflux transporter MFP subunit  32.51 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  29.34 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  29.34 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  29.34 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  28.93 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  29.34 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2212  secretion protein HlyD family protein  27.94 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420088  hitchhiker  0.000529238 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000563  multidrug resistance efflux pump  31.72 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0293692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1252  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.18 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.47 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3693  secretion protein HlyD family protein  31.79 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4163  HlyD family secretion protein  26.67 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  23.84 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13560  hypothetical protein  31.38 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  28.46 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3339  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.647013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4866  RND family efflux transporter MFP subunit  32.64 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1214  hypothetical protein  31.38 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6854  HlyD family secretion protein  30.99 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  27.76 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1922  putative secretion protein  25.39 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.350585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1291  secretion protein HlyD family protein  28.87 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0173  secretion protein HlyD  28.17 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.992888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3003  secretion protein HlyD family protein  31.91 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4391  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.08 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4009  secretion protein HlyD family protein  31.45 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.105692 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05325  hypothetical protein  30.39 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2585  secretion protein HlyD  29.37 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.798515 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001143  fusaric acid resistance protein fusE  27.36 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1048  secretion protein HlyD  31.02 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.233683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3658  multidrug resistance efflux pump  25.86 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3668  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  29.17 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3826  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeA  27.98 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2404  RND family efflux transporter MFP subunit  32.24 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.416269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1220  fusaric acid resistance protein, putative  31.02 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  0.852647 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0505  secretion protein HlyD family protein  25.39 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0758  HlyD family secretion protein  29.41 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0191383  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  30.48 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  29.48 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  29.72 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4318  secretion protein HlyD family protein  31.15 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5221  secretion protein HlyD family protein  32.82 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.011991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1991  secretion protein HlyD  28.38 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0781323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0683  secretion protein HlyD family protein  24.92 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.346077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>