86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1265 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 481 aa  956    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  64.19 
 
 		 479 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  62.88 
 
 		 477 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  58.19 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  55 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  53.11 
 
 		 486 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  55 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  53.08 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  50.68 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  50.22 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  52.18 
 
 		 500 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  50.89 
 
 		 498 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  52.18 
 
 		 500 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  53.6 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  52.37 
 
 		 500 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  52.93 
 
 		 523 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  51.14 
 
 		 554 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  51.52 
 
 		 554 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  51.14 
 
 		 554 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  51.49 
 
 		 536 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  46.93 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  46.93 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  39.74 
 
 		 485 aa  317  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  38.6 
 
 		 483 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  39.07 
 
 		 535 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  40.78 
 
 		 488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  38.94 
 
 		 535 aa  302  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  38.36 
 
 		 488 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  42.24 
 
 		 472 aa  300  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  41.85 
 
 		 470 aa  299  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  38.39 
 
 		 485 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  41.92 
 
 		 475 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  42.26 
 
 		 475 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  40.75 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  39.16 
 
 		 543 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  41.04 
 
 		 476 aa  292  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  42.18 
 
 		 475 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  38.12 
 
 		 475 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  41.6 
 
 		 476 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  41.63 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  40.93 
 
 		 472 aa  282  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  39.87 
 
 		 486 aa  276  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  37.58 
 
 		 486 aa  273  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  36.67 
 
 		 488 aa  256  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  38.78 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  38.23 
 
 		 483 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  42.53 
 
 		 477 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  42.53 
 
 		 477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  41.56 
 
 		 475 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  36.73 
 
 		 399 aa  200  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  34.03 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  30.29 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2283  outer membrane efflux protein  27.83 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0495  outer membrane efflux protein  28.53 
 
 		 493 aa  94.4  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  26.23 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.79 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 479 aa  57  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  21.17 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.56 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  25.21 
 
 		 408 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 426 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  24.75 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  24.53 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  25.2 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0288  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 464 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.708573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 437 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1551  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  24.24 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  21.79 
 
 		 438 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 464 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  25.46 
 
 		 414 aa  43.9  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  25.32 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>