85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1819 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 334 aa  661    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  40.18 
 
 		 344 aa  249  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  41.86 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.64 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  29.34 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  29.34 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  29.34 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  29.34 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  29.34 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  29.34 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  29.34 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  31.23 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  29.04 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  29.59 
 
 		 336 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.05 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  29.31 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  28.04 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  28.04 
 
 		 324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.85 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  24.85 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  25.94 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  30.15 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  27.49 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  23.9 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.8 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  23.21 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 378 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  26.05 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  25.61 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  25.88 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  21.85 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.72 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  24.13 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  24.91 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  27.57 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  27.1 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.08 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  22.01 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  22.44 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.01 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1173  DNA polymerase III, delta subunit  24.23 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163613  hitchhiker  0.0000000248106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  22.82 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  21.54 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  27.71 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.23 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  21.85 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  23.57 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  25.32 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  20.86 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  29.02 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5512  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.504789 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  21.05 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  29.79 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  22.6 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  25.2 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  26.44 
 
 		 329 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  22.26 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  23.26 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  22.19 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  23.26 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  24.54 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0772  hypothetical protein  20.61 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.421798  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0072  DNA polymerase III subunit delta  26.82 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  21.73 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  22.87 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl368  hypothetical protein  23.57 
 
 		 319 aa  49.3  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.42314e-33  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  25.17 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  22.49 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  22.73 
 
 		 345 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  19.31 
 
 		 338 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.67 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  24.47 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  24.47 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  20.93 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0335  DNA polymerase III, delta subunit superfamily  23.44 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.874049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  19.2 
 
 		 328 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  27.42 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5666  DNA polymerase III, delta subunit  25.62 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0699  DNA polymerase III delta  25.18 
 
 		 305 aa  43.5  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000587672  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  22.83 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  23.88 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1739  DNA polymerase III subunit delta  24.23 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.353532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>