More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2096 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2096  pantoate/beta-alanine ligase  100 
 
 		 302 aa  598  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.985614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32010  pantothenate synthetase  65.23 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  57.46 
 
 		 294 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0200  pantoate--beta-alanine ligase  56.76 
 
 		 360 aa  275  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  56.77 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8383  pantoate/beta-alanine ligase  54.92 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.857994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  56.27 
 
 		 285 aa  261  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0460  pantothenate synthetase  54.85 
 
 		 334 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0575  pantoate--beta-alanine ligase  57.75 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.447307  normal  0.0256844 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4375  pantoate--beta-alanine ligase  58.78 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  44.83 
 
 		 282 aa  252  7e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4981  pantoate/beta-alanine ligase  54.28 
 
 		 289 aa  251  8.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199543  normal  0.96569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0160  pantoate--beta-alanine ligase  50.89 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0323  pantoate--beta-alanine ligase  52.57 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2884  pantothenate synthetase  53.93 
 
 		 296 aa  246  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  48.45 
 
 		 277 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  47.42 
 
 		 277 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0211  pantothenate synthetase  57.2 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.120689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4718  pantoate--beta-alanine ligase  58.59 
 
 		 282 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  46.55 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_002936  DET0804  pantoate--beta-alanine ligase  50.78 
 
 		 268 aa  238  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0135127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0090  pantoate/beta-alanine ligase  52.81 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0632  pantoate/beta-alanine ligase  58.5 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3003  pantoate--beta-alanine ligase  49.48 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  43.94 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  43.6 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  43.6 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  48.83 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  41.87 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  47.2 
 
 		 280 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  46.92 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0635  pantoate/beta-alanine ligase  53.93 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.53875  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4283  pantoate--beta-alanine ligase  56.64 
 
 		 282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12880  pantothenate synthetase  52.9 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00593935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2788  pantothenate synthetase  49.31 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  42.76 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  52.96 
 
 		 278 aa  228  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  51.55 
 
 		 289 aa  227  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1525  pantoate-beta-alanine ligase  48.44 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.102611  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0716  pantoate/beta-alanine ligase  53.9 
 
 		 618 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.34765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  42.07 
 
 		 281 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2469  pantothenate synthetase  48.68 
 
 		 291 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163424  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1424  pantoate--beta-alanine ligase  54.23 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.172502 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0830  pantoate/beta-alanine ligase  45.21 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1518  pantoate--beta-alanine ligase  49.42 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1134  pantoate/beta-alanine ligase  45.27 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.39 
 
 		 529 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  45.17 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3149  pantoate--beta-alanine ligase  46.62 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35550  pantoate--beta-alanine ligase  52.9 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0479281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  48.83 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0667  pantoate--beta-alanine ligase  46.92 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4762  pantoate--beta-alanine ligase  54.65 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4848  pantoate--beta-alanine ligase  54.65 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0717789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1634  pantoate--beta-alanine ligase  46.27 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  44.48 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1014  pantoate--beta-alanine ligase  49.42 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0436  pantoate/beta-alanine ligase  46.39 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5148  pantoate--beta-alanine ligase  54.65 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  46.82 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  45.33 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  44.53 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  46.48 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.39 
 
 		 539 aa  216  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2952  pantothenate synthase  50.19 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.215567  normal  0.0184604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  47.33 
 
 		 289 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2254  pantoate/beta-alanine ligase  42.81 
 
 		 289 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  45.59 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  41.58 
 
 		 279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  44.1 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  50.97 
 
 		 527 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  40 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0134  pantoate/beta-alanine ligase  44.09 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2791  pantoate--beta-alanine ligase  49.41 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4783  pantoate--beta-alanine ligase  48.24 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1370  pantoate--beta-alanine ligase  39.79 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  38.97 
 
 		 282 aa  212  7e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0567  pantoate/beta-alanine ligase  52.9 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.566443  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0600  pantoate--beta-alanine ligase  47.53 
 
 		 283 aa  211  7.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  48.56 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  43.88 
 
 		 288 aa  211  9e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4462  pantoate/beta-alanine ligase  44.96 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  51.37 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0476  pantoate--beta-alanine ligase  42.41 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.87 
 
 		 534 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  46.06 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  45.7 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4007  pantoate/beta-alanine ligase  50.78 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  45.7 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  49.24 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  47.06 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  37.93 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0464  pantoate/beta-alanine ligase  46.79 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3332  pantoate--beta-alanine ligase  43.05 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0553  pantoate--beta-alanine ligase  44.49 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01440  pantothenate synthetase  47.84 
 
 		 343 aa  209  5e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  43.03 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  46.21 
 
 		 284 aa  208  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>