More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1987 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  100 
 
 		 271 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  54.61 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  55.94 
 
 		 261 aa  234  9e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  50.96 
 
 		 259 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2843  NLP/P60 protein  44.13 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0883  NLP/P60 protein  40.21 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  56.72 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  52.17 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  51.75 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0122  NLP/P60 protein  53.27 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  56.03 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  53.06 
 
 		 556 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09120  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.11 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44.36 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 368 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  47.52 
 
 		 535 aa  99.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.67 
 
 		 327 aa  99  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 391 aa  98.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  48.33 
 
 		 318 aa  98.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  38.73 
 
 		 197 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.48 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  38.1 
 
 		 333 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  32.8 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 524 aa  95.5  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  46.6 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 200 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11930  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.27 
 
 		 176 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.39384 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1786  cell wall-associated hydrolase  53.41 
 
 		 246 aa  93.2  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  42.73 
 
 		 367 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 370 aa  92  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  45.76 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0399  NlpC/P60 family protein  36.65 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  41.51 
 
 		 1048 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  34.09 
 
 		 368 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 232 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  40 
 
 		 392 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  51.14 
 
 		 208 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  37.34 
 
 		 487 aa  89.4  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  52.56 
 
 		 317 aa  89.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  50.59 
 
 		 332 aa  89.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.55 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 210 aa  88.6  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 452 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  53.49 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  33.99 
 
 		 202 aa  87.8  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  47.78 
 
 		 216 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  40.78 
 
 		 476 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  44.19 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  46.15 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  40.15 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  46.15 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  42.86 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  36.28 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  38.1 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  46.51 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  50 
 
 		 395 aa  82.4  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  40 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 349 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  36.36 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  33.55 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  39.32 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  40.2 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  41.49 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.58 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  39.84 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  39.82 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  46.34 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.78 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  28.92 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  37.01 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 532 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  33.14 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  34.72 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  37.78 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  36.09 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  39.42 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.38 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  29.58 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  40.19 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  40.23 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  40.38 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  40.18 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  42.7 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  38.64 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  36.27 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  42.16 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  35.66 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>