More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1851 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1851  ABC transporter related  100 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0521462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2810  ABC transporter related protein  50.74 
 
 		 367 aa  191  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1067  ABC transporter related  51.24 
 
 		 346 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2904  ABC transporter related  50.97 
 
 		 371 aa  178  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000149556  hitchhiker  0.0000207789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3746  ABC transporter related  49.51 
 
 		 358 aa  177  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3481  ABC transporter related  52.22 
 
 		 361 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18140  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  46.27 
 
 		 347 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0277574  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2797  ABC transporter related  48.29 
 
 		 358 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0923518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2841  ABC transporter related  48.29 
 
 		 358 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2824  ABC transporter related  48.29 
 
 		 358 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2304  ABC transporter related protein  47.42 
 
 		 335 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11887  molybdenum-transport ATP-binding protein ABC transporter modC  45.02 
 
 		 369 aa  168  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.189327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34120  ABC-type sulfate/molybdate transport systems, ATPase component  45.07 
 
 		 372 aa  168  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4175  ABC transporter related  46.08 
 
 		 391 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2536  ABC transporter-related protein  52.49 
 
 		 359 aa  158  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2734  ABC transporter related  47.18 
 
 		 354 aa  154  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.188304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9029  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.42 
 
 		 343 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  43.27 
 
 		 396 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3861  ABC transporter related  47.32 
 
 		 358 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.196847  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.36 
 
 		 362 aa  151  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 		 353 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  45.08 
 
 		 352 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2547  ABC transporter related  45.92 
 
 		 354 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3271  ABC transporter related  40.62 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.800565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  41.18 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  38.34 
 
 		 360 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.38 
 
 		 354 aa  148  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.37 
 
 		 376 aa  147  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  43.72 
 
 		 355 aa  147  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 353 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.97 
 
 		 343 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  41.94 
 
 		 349 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  41.97 
 
 		 343 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 354 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.97 
 
 		 343 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 353 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  40.98 
 
 		 356 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  41.97 
 
 		 347 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 		 378 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  39.49 
 
 		 356 aa  145  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  38.02 
 
 		 353 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  44.74 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 		 348 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  41.84 
 
 		 345 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 346 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  41.63 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  42.19 
 
 		 351 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0892  ABC transporter related  39.29 
 
 		 232 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.494733  normal  0.0891232 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 		 371 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3986  ABC transporter related  41.54 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.363465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  40.21 
 
 		 344 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  41.83 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  40.21 
 
 		 352 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  43.08 
 
 		 371 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  43.35 
 
 		 368 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1531  ABC transporter related  39.89 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.952965  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  37.67 
 
 		 342 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.97 
 
 		 340 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2557  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 402 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000490216  normal  0.117456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 		 347 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0212  ABC transporter related  39.15 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.701682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  38.86 
 
 		 378 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  43.08 
 
 		 398 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  40.86 
 
 		 349 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  40.86 
 
 		 349 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.04 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  40.86 
 
 		 349 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 346 aa  142  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  39.27 
 
 		 279 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  37.89 
 
 		 248 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  40.21 
 
 		 352 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.1 
 
 		 344 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  37.5 
 
 		 353 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  37.89 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2820  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 349 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  41.15 
 
 		 345 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.19 
 
 		 354 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  40.78 
 
 		 350 aa  141  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  40.32 
 
 		 349 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.58 
 
 		 357 aa  141  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 343 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 		 346 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  38.54 
 
 		 346 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.49 
 
 		 349 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.59 
 
 		 345 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.41 
 
 		 327 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  38.54 
 
 		 346 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  38.22 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  39.49 
 
 		 349 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  42.63 
 
 		 361 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  38.54 
 
 		 346 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 351 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  37.7 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  39.49 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1796  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 		 376 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.356789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.07 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1299  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 394 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0956135  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.38 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  37.31 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  41.58 
 
 		 353 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>