90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0459 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  47.47 
 
 		 2052 aa  1564    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  35.25 
 
 		 2067 aa  856    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  31.72 
 
 		 2084 aa  662    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  33.47 
 
 		 2027 aa  699    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  34.02 
 
 		 2011 aa  782    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  33.46 
 
 		 2051 aa  752    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  32.37 
 
 		 2039 aa  703    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 2043 aa  4052    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  34.11 
 
 		 2040 aa  793    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  42.63 
 
 		 2047 aa  1317    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  34.28 
 
 		 2056 aa  805    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1994 aa  806    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  30.3 
 
 		 2069 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1329  hypothetical protein  34.56 
 
 		 1001 aa  387  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  29.95 
 
 		 1052 aa  181  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  32.88 
 
 		 9585 aa  110  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.78 
 
 		 2192 aa  92.8  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1879 aa  92  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  32.49 
 
 		 2042 aa  79  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  26.31 
 
 		 1597 aa  78.2  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  30.14 
 
 		 864 aa  77.4  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  24.53 
 
 		 1367 aa  76.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.15 
 
 		 850 aa  75.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  27.65 
 
 		 1628 aa  75.9  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  38.78 
 
 		 448 aa  74.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  24.13 
 
 		 721 aa  72  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.92 
 
 		 761 aa  70.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  26.69 
 
 		 1269 aa  69.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  24.67 
 
 		 3191 aa  69.3  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  48.81 
 
 		 2476 aa  68.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  27.46 
 
 		 1268 aa  67.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  33.8 
 
 		 1199 aa  67  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  29.22 
 
 		 1215 aa  66.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.22 
 
 		 1215 aa  66.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.88 
 
 		 1215 aa  64.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.21 
 
 		 2114 aa  64.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  30.36 
 
 		 865 aa  63.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.73 
 
 		 3816 aa  63.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  45.83 
 
 		 2522 aa  62.8  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  43.18 
 
 		 3544 aa  62.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  26.93 
 
 		 1269 aa  62  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  32.77 
 
 		 3911 aa  61.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.07 
 
 		 994 aa  62  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  28.46 
 
 		 8321 aa  61.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.53 
 
 		 1884 aa  61.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  28.04 
 
 		 2153 aa  60.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  30.85 
 
 		 701 aa  60.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  30.1 
 
 		 814 aa  60.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  29.34 
 
 		 2816 aa  60.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.63 
 
 		 3699 aa  60.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.18 
 
 		 3699 aa  60.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  30.18 
 
 		 2503 aa  59.7  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  27.41 
 
 		 1215 aa  59.7  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  27.41 
 
 		 1215 aa  59.3  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 744 aa  58.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  28.48 
 
 		 892 aa  58.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1061 aa  58.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 		 680 aa  57  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  26.84 
 
 		 454 aa  56.6  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  35.2 
 
 		 1550 aa  56.2  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  31.84 
 
 		 938 aa  55.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  31.03 
 
 		 1067 aa  55.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  28.33 
 
 		 771 aa  54.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8514  Fibronectin type III domain protein  30.81 
 
 		 822 aa  54.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0801295  normal  0.0555709 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  31.37 
 
 		 1911 aa  53.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  25.14 
 
 		 725 aa  52.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  26.85 
 
 		 3333 aa  52  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  21.25 
 
 		 1363 aa  52  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  35.14 
 
 		 3927 aa  52.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.07 
 
 		 4122 aa  51.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  27.18 
 
 		 4978 aa  51.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  31.22 
 
 		 1428 aa  50.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.01 
 
 		 1462 aa  50.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  31.13 
 
 		 804 aa  50.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  42.27 
 
 		 1848 aa  50.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  27.49 
 
 		 3089 aa  49.3  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.32 
 
 		 6885 aa  48.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  29.66 
 
 		 2767 aa  48.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1416 aa  48.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  30.06 
 
 		 2068 aa  48.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  30.86 
 
 		 762 aa  47.8  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  26.13 
 
 		 5745 aa  46.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  28.79 
 
 		 692 aa  46.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  29.28 
 
 		 4848 aa  46.2  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  27.34 
 
 		 2670 aa  46.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  27.4 
 
 		 480 aa  46.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  26.26 
 
 		 2353 aa  46.2  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  24.4 
 
 		 2839 aa  45.8  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  32.61 
 
 		 1131 aa  45.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  29.77 
 
 		 1238 aa  45.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>