104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0110 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 759 aa  1531    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 774 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  24.29 
 
 		 1132 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  23.7 
 
 		 1132 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  24.01 
 
 		 791 aa  162  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  24.34 
 
 		 947 aa  161  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  22.17 
 
 		 859 aa  157  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1090 aa  156  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  23.66 
 
 		 792 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  21.63 
 
 		 868 aa  147  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  23.84 
 
 		 1016 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  22.53 
 
 		 787 aa  126  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  21.08 
 
 		 797 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  22.37 
 
 		 1143 aa  126  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.36 
 
 		 917 aa  126  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 		 1177 aa  124  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 		 773 aa  123  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  22.31 
 
 		 788 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 792 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  23.49 
 
 		 793 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  18.52 
 
 		 1068 aa  115  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  23.21 
 
 		 788 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  24.56 
 
 		 1110 aa  112  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.94 
 
 		 876 aa  112  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.1 
 
 		 1211 aa  112  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  25.15 
 
 		 789 aa  109  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  20.54 
 
 		 792 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  25 
 
 		 1232 aa  107  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 		 786 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  21.54 
 
 		 787 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  22.61 
 
 		 793 aa  104  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  21.56 
 
 		 787 aa  100  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  23.02 
 
 		 790 aa  99  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  20.87 
 
 		 789 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  20.87 
 
 		 789 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  20.6 
 
 		 749 aa  95.5  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  22.58 
 
 		 787 aa  95.1  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  19.76 
 
 		 787 aa  94.7  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  22.79 
 
 		 787 aa  93.2  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  21.2 
 
 		 800 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  21.1 
 
 		 787 aa  93.2  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  20.22 
 
 		 788 aa  92.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  20.34 
 
 		 737 aa  92.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  19.95 
 
 		 788 aa  88.6  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  22.36 
 
 		 791 aa  86.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  18.09 
 
 		 743 aa  86.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  20.94 
 
 		 788 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  20.32 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  22.37 
 
 		 787 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  20.05 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  20.83 
 
 		 789 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  21.04 
 
 		 793 aa  71.2  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  21.88 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  22.19 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 		 787 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  21.35 
 
 		 787 aa  69.3  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  21.77 
 
 		 786 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 786 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 786 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  26.11 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.27 
 
 		 841 aa  57.4  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0792  hypothetical protein  27.05 
 
 		 714 aa  57.4  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  21.1 
 
 		 787 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  26.14 
 
 		 854 aa  56.6  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  21.54 
 
 		 789 aa  55.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  21.26 
 
 		 787 aa  54.7  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  23.48 
 
 		 416 aa  51.2  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.71 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.88 
 
 		 408 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.42 
 
 		 422 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  27.66 
 
 		 419 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4145  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.4 
 
 		 428 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.71 
 
 		 434 aa  48.9  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.7 
 
 		 417 aa  48.5  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  23.94 
 
 		 834 aa  48.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2598  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.66 
 
 		 426 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3316  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.53 
 
 		 461 aa  47.8  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2346  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.33 
 
 		 416 aa  47.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.94 
 
 		 422 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.7 
 
 		 417 aa  47.8  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  24.41 
 
 		 422 aa  47  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.21 
 
 		 426 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0473  hypothetical protein  22.73 
 
 		 807 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  23.26 
 
 		 413 aa  47  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  27.87 
 
 		 378 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  22.15 
 
 		 780 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.82 
 
 		 417 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.58 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 		 848 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.26 
 
 		 851 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.64 
 
 		 417 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.64 
 
 		 417 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.34 
 
 		 426 aa  45.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  20.8 
 
 		 821 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.64 
 
 		 417 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05510  cell division protein  21.23 
 
 		 304 aa  45.1  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0919  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.13 
 
 		 436 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2404  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.02 
 
 		 438 aa  44.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.311939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  22.07 
 
 		 831 aa  44.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.41 
 
 		 417 aa  44.7  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>