More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3447 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  43.57 
 
 		 995 aa  711    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.73 
 
 		 999 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  41.08 
 
 		 1004 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  41.71 
 
 		 1000 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  41.76 
 
 		 1003 aa  679    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  41.07 
 
 		 1028 aa  683    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  63.3 
 
 		 980 aa  1226    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.18 
 
 		 1004 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  39.96 
 
 		 1007 aa  680    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  39.96 
 
 		 1007 aa  680    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  43.13 
 
 		 999 aa  726    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  50.36 
 
 		 1009 aa  903    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.57 
 
 		 993 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  40.91 
 
 		 1006 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  43.46 
 
 		 997 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.75 
 
 		 995 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  49.24 
 
 		 1009 aa  896    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  49.44 
 
 		 992 aa  893    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  40.66 
 
 		 1006 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  44.13 
 
 		 995 aa  722    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  49.74 
 
 		 984 aa  868    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  41.53 
 
 		 1003 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  41.28 
 
 		 1002 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  49.95 
 
 		 985 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.31 
 
 		 974 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  40.02 
 
 		 1005 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.11 
 
 		 999 aa  719    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  43.37 
 
 		 993 aa  723    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.97 
 
 		 1003 aa  693    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  41.2 
 
 		 1003 aa  683    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.74 
 
 		 1005 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  41.72 
 
 		 997 aa  701    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  44.01 
 
 		 995 aa  713    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  41.08 
 
 		 1002 aa  692    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.8 
 
 		 1003 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  50 
 
 		 987 aa  905    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  49.49 
 
 		 984 aa  873    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.26 
 
 		 998 aa  669    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.27 
 
 		 1009 aa  728    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  43.27 
 
 		 997 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  100 
 
 		 976 aa  1996    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.66 
 
 		 1003 aa  687    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  41.73 
 
 		 1000 aa  717    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.91 
 
 		 1019 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.66 
 
 		 1003 aa  696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  48.93 
 
 		 987 aa  905    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.23 
 
 		 984 aa  976    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.54 
 
 		 1011 aa  696    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  50.31 
 
 		 1008 aa  908    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  42.06 
 
 		 999 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  62.08 
 
 		 981 aa  1221    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.56 
 
 		 1003 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  40.3 
 
 		 1010 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  43.13 
 
 		 997 aa  711    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.93 
 
 		 997 aa  702    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.18 
 
 		 1004 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  41.77 
 
 		 1005 aa  658    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.03 
 
 		 1005 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  41.38 
 
 		 1002 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.72 
 
 		 1003 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.6 
 
 		 993 aa  719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  41.87 
 
 		 1005 aa  664    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  41.56 
 
 		 1003 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  51.77 
 
 		 989 aa  870    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  42.03 
 
 		 1000 aa  729    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  42.2 
 
 		 977 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  52.42 
 
 		 976 aa  977    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  41.38 
 
 		 1002 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  47.91 
 
 		 987 aa  865    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  44.03 
 
 		 995 aa  720    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  47.01 
 
 		 984 aa  831    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  39.24 
 
 		 1005 aa  617  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  40.27 
 
 		 889 aa  566  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  36.64 
 
 		 984 aa  510  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  37.69 
 
 		 980 aa  506  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  39.71 
 
 		 955 aa  492  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  37.16 
 
 		 925 aa  488  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.47 
 
 		 967 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  39.11 
 
 		 937 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  33.63 
 
 		 965 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  32.63 
 
 		 961 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  34.02 
 
 		 961 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.31 
 
 		 988 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  32.43 
 
 		 968 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  32.73 
 
 		 968 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.47 
 
 		 963 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  32.5 
 
 		 977 aa  442  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.08 
 
 		 767 aa  416  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  48.01 
 
 		 909 aa  388  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.36 
 
 		 857 aa  131  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2805  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 802 aa  124  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.898682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.86 
 
 		 478 aa  119  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.65 
 
 		 452 aa  118  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 806 aa  118  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  28.57 
 
 		 442 aa  114  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  28.57 
 
 		 440 aa  114  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.28 
 
 		 362 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  30.79 
 
 		 381 aa  112  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1940  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 830 aa  109  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.239261  normal  0.0111129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 816 aa  108  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>