221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2310 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2310  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
452 aa  891    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2478  ferredoxin / FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.86 
 
 
429 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1380  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.48 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1476  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.24 
 
 
429 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40 
 
 
452 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.232335  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.23 
 
 
963 aa  154  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  26.05 
 
 
961 aa  150  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  30.22 
 
 
968 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3287  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.88 
 
 
987 aa  142  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  29.78 
 
 
968 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3993  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.48 
 
 
995 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  29.84 
 
 
1000 aa  136  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.87 
 
 
977 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  28.57 
 
 
965 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3447  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.65 
 
 
976 aa  133  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4033  sarcosine oxidase, alpha subunit family  33.56 
 
 
995 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.319981  normal  0.145852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3738  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  33.56 
 
 
995 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.6 
 
 
967 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.48 
 
 
1000 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  28.6 
 
 
977 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.91 
 
 
1003 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5916  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.23 
 
 
988 aa  126  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.564133 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3377  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.93 
 
 
984 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.958217 
 
 
-
 
NC_004310  BR0231  sarcosine oxidase, alpha subunit  31.25 
 
 
999 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  29.57 
 
 
1003 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.22 
 
 
1002 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.69 
 
 
1003 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  33.79 
 
 
995 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0224  sarcosine oxidase alpha subunit  31.25 
 
 
909 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0303  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.56 
 
 
999 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.16 
 
 
1011 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.99 
 
 
993 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.27 
 
 
1003 aa  124  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.63 
 
 
999 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.03 
 
 
995 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  31.75 
 
 
993 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  30.24 
 
 
1002 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0454  aminomethyltransferase  29.37 
 
 
961 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.343433  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0593  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30 
 
 
997 aa  121  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.967493  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  29.72 
 
 
1003 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  30.22 
 
 
1002 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  30.22 
 
 
1002 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.71 
 
 
993 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.85 
 
 
1003 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.85 
 
 
1003 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.85 
 
 
1003 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.85 
 
 
1003 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5744  sarcosine oxidase alpha subunit  31.76 
 
 
987 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100825  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.7 
 
 
1003 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2145  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.59 
 
 
981 aa  117  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  30.09 
 
 
985 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2264  putative sarcosine oxidase  29.8 
 
 
980 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  30.75 
 
 
1008 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0089  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.32 
 
 
478 aa  114  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000828017  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0938  hypothetical protein  28.15 
 
 
469 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.903873  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  28.18 
 
 
1028 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.04 
 
 
974 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  34.24 
 
 
998 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1579  sarcosine oxidase, alpha subunit family  30.41 
 
 
1009 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  25.93 
 
 
1007 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  25.93 
 
 
1007 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  28.73 
 
 
1000 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1652  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.27 
 
 
1009 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.90362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.66 
 
 
1019 aa  106  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4048  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.66 
 
 
1005 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.02 
 
 
1009 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8586  sarcosine oxidase, alpha subunit family  31.19 
 
 
999 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.523076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1143  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.09 
 
 
987 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.983501 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4907  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.7 
 
 
976 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.232501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3777  sarcosine oxidase alpha subunit  31.16 
 
 
997 aa  103  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  31.72 
 
 
992 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5633  sarcosine oxidase, alpha subunit family  29.57 
 
 
984 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.43 
 
 
1005 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.78 
 
 
1005 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2638  sarcosine oxidase, alpha subunit family  27.97 
 
 
984 aa  99  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.16 
 
 
1006 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3658  sarcosine oxidase, alpha subunit family  31.99 
 
 
997 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.259851  normal  0.147827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3356  sarcosine oxidase, alpha subunit family  29.51 
 
 
997 aa  97.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.4 
 
 
1005 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  29.54 
 
 
1004 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  27.96 
 
 
1006 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.54 
 
 
1004 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.54 
 
 
1004 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  30.29 
 
 
1005 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  30.6 
 
 
1005 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2364  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.1 
 
 
984 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.442559  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.61 
 
 
1010 aa  90.9  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0971  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.58 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00191476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  32.13 
 
 
989 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272798  normal  0.7148 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  30.99 
 
 
889 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
983 aa  81.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2750  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.98 
 
 
997 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0972  sarcosine oxidase, alpha subunit  42.31 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000186283  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 
984 aa  70.1  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1531  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.16 
 
 
409 aa  63.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.49 
 
 
984 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  34.69 
 
 
980 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2742  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  28.12 
 
 
493 aa  60.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  0.340256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1679  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.15 
 
 
412 aa  60.1  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  30.13 
 
 
937 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>