203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2944 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2944  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
295 aa  603  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000229991  decreased coverage  0.00000886209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4566  polysaccharide deacetylase  55.4 
 
 
304 aa  317  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0399  polysaccharide deacetylase  54.23 
 
 
301 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1056  polysaccharide deacetylase  41.46 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8430  polysaccharide deacetylase  39.01 
 
 
298 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3154  polysaccharide deacetylase  37.46 
 
 
294 aa  185  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0562684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2733  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.437035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5337  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
297 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135454  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4850  polysaccharide deacetylase  31.94 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1969  polysaccharide deacetylase  32.38 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25912  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2734  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 
307 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562399  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0601  putative polysaccharide deacetylase  31.09 
 
 
300 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7199  hypothetical protein  31.19 
 
 
475 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1744  urate catabolism protein  34.04 
 
 
470 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3554  hypothetical protein  28.47 
 
 
313 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2063  urate catabolism protein  33.58 
 
 
470 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1069  urate catabolism protein  33.33 
 
 
470 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0248428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1363  hypothetical protein  29.82 
 
 
321 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0722651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5365  urate catabolism protein  32.96 
 
 
478 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5255  polysaccharide deacetylase  30.31 
 
 
321 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.339328 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5904  polysaccharide deacetylase  30.58 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1053  hypothetical protein  30.66 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5147  polysaccharide deacetylase  29.96 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.472101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  31.46 
 
 
478 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3306  polysaccharide deacetylase  33.2 
 
 
296 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3035  chitin deacetylase  31.79 
 
 
471 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  33.33 
 
 
471 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5844  urate catabolism protein  30.91 
 
 
387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0355  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.0556603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4195  polysaccharide deacetylase  28.52 
 
 
318 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0206  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
471 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0429  polysaccharide deacetylase  28.78 
 
 
307 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3707  urate catabolism protein  31.46 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.482899  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1554  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 
471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.442375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3290  chitin deacetylase  29.59 
 
 
482 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187371  normal  0.839044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  34.88 
 
 
475 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3355  hypothetical protein  32.58 
 
 
306 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  31.97 
 
 
475 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  31.97 
 
 
475 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 
330 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  26.97 
 
 
330 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 
308 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
312 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  30.63 
 
 
316 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  28.41 
 
 
308 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 
334 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  31.5 
 
 
317 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  27.53 
 
 
308 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 
316 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  31.14 
 
 
317 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 
317 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 
317 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0901  urate catabolism protein  29.72 
 
 
316 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  28.04 
 
 
308 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1058  polysaccharide deacetylase family protein  29.93 
 
 
316 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1111  urate catabolism protein  29.93 
 
 
316 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.808218  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  29.24 
 
 
293 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  31.62 
 
 
317 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
359 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3151  polysaccharide deacetylase  30.63 
 
 
295 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal  0.0334716 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 
336 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 
470 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  28.04 
 
 
308 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 
316 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  30.42 
 
 
301 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  29 
 
 
309 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  27.53 
 
 
308 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  29.86 
 
 
322 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0916  chitin deacetylase  28.15 
 
 
312 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  30.77 
 
 
332 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  26.97 
 
 
334 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2608  polysaccharide deacetylase  30.07 
 
 
470 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.234618  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 
336 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
341 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 
336 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2888  urate catabolism protein  29.92 
 
 
307 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558847  normal  0.0871438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 
309 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  30.19 
 
 
317 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
471 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 
332 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  28.94 
 
 
309 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  29.32 
 
 
314 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  29.26 
 
 
336 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0078  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3152  urate catabolism protein  29.55 
 
 
307 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  30 
 
 
336 aa  99.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  28.57 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3927  urate catabolism protein  28.83 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1163  chitin deacetylase  29.63 
 
 
307 aa  99  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.425036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0869  urate catabolism protein  27.84 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2422  polysaccharide deacetylase  28.77 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  29.43 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  28.62 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0777  hypothetical protein  29.54 
 
 
314 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  28.94 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0659  urate catabolism protein  28.78 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  29.81 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  29.81 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  29.81 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>