71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2572 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2572  hypothetical protein  100 
 
 
870 aa  1692    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0907  hypothetical protein  36.22 
 
 
873 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00680218  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5391  SMC domain protein  38 
 
 
875 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60819  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  27.18 
 
 
880 aa  210  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2302  SMC domain-containing protein  29.74 
 
 
880 aa  180  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0512218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3142  DNA repair ATPase-like protein  29.77 
 
 
875 aa  164  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3042  putative GTP-binding protein  27.48 
 
 
880 aa  157  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0398  putative GTP-binding protein  28.91 
 
 
878 aa  154  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126462  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1226  GTP-binding protein  25.95 
 
 
875 aa  127  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5217  putative GTP-binding protein  32.6 
 
 
878 aa  118  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81586  normal  0.196826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1248  hypothetical protein  43.7 
 
 
888 aa  92.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.836772  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4996  hypothetical protein  36.91 
 
 
881 aa  91.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.96047  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1236  putative GTP-binding protein  34.48 
 
 
874 aa  91.3  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0710819  normal  0.307614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5376  SMC domain protein  33.33 
 
 
874 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.558222  normal  0.369083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  31.02 
 
 
877 aa  84.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  31.02 
 
 
877 aa  84.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  31.02 
 
 
877 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23970  hypothetical protein  34.25 
 
 
874 aa  74.3  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0772565  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  37.58 
 
 
877 aa  69.7  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  27.69 
 
 
875 aa  68.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  31.58 
 
 
883 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1688  SMC domain protein  27.59 
 
 
892 aa  65.5  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.319836  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1788  DNA repair ATPase-like protein  27.8 
 
 
901 aa  63.9  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.284461  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  30.92 
 
 
885 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  29.95 
 
 
955 aa  60.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0069  hypothetical protein  36.26 
 
 
1284 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.774464  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0737  hypothetical protein  36.78 
 
 
1282 aa  57  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.138664  normal  0.287489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1896  hypothetical protein  25 
 
 
978 aa  55.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.428817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1930  hypothetical protein  25 
 
 
978 aa  55.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0821  SMC domain-containing protein  29.08 
 
 
917 aa  54.7  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0839342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2412  SMC protein-like protein  33.33 
 
 
883 aa  54.7  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00784167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0827  hypothetical protein  33.74 
 
 
1137 aa  54.7  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4579  SMC domain protein  40.62 
 
 
1179 aa  52  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1746  hypothetical protein  36.36 
 
 
1065 aa  51.6  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3624  hypothetical protein  35.82 
 
 
1351 aa  51.2  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13301  RecF protein:ABC transporter  31.43 
 
 
918 aa  51.2  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.639467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3016  hypothetical protein  27.38 
 
 
1185 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0872848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1379  hypothetical protein  25.24 
 
 
979 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2464  hypothetical protein  27.34 
 
 
1051 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0919  hypothetical protein  34.85 
 
 
974 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  22.86 
 
 
888 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  26.04 
 
 
1074 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3237  hypothetical protein  32 
 
 
1158 aa  49.3  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5507  hypothetical protein  39.06 
 
 
1160 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00070285  hitchhiker  0.00245225 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1266  hypothetical protein  24.64 
 
 
830 aa  49.3  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000181309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1663  hypothetical protein  45.31 
 
 
1201 aa  49.7  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.155855  normal  0.337314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1110  hypothetical protein  33.33 
 
 
974 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0926  hypothetical protein  33.33 
 
 
974 aa  48.1  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0795  hypothetical protein  33.33 
 
 
973 aa  48.1  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0932  hypothetical protein  33.33 
 
 
974 aa  48.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1179  hypothetical protein  33.33 
 
 
974 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.016344  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0946  hypothetical protein  33.33 
 
 
767 aa  48.1  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1051  hypothetical protein  33.33 
 
 
974 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1011  hypothetical protein  33.33 
 
 
767 aa  48.1  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1459  SMC domain protein  31.52 
 
 
1171 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1092  hypothetical protein  37.14 
 
 
1210 aa  47.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69355  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27850  hypothetical protein  33.85 
 
 
729 aa  47.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.817554  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2126  hypothetical protein  33.33 
 
 
922 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06380  hypothetical protein  30.21 
 
 
968 aa  47.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4250  hypothetical protein  33.33 
 
 
974 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000724853 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1098  SMC domain-containing protein  32.14 
 
 
917 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.920672  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0729  DNA repair ATPase  31.52 
 
 
787 aa  46.6  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  36.51 
 
 
723 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3281  SMC domain-containing protein  40 
 
 
1047 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0049  hypothetical protein  32.26 
 
 
1155 aa  45.8  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3341  hypothetical protein  40.85 
 
 
1047 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0103  hypothetical protein  35.71 
 
 
711 aa  46.2  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0032  hypothetical protein  28.79 
 
 
664 aa  45.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1086  hypothetical protein  33.85 
 
 
94 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.88944e-60 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1246  hypothetical protein  27.06 
 
 
1354 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1989  hypothetical protein  36.9 
 
 
1348 aa  44.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>