More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3011 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  70.98 
 
 		 497 aa  729    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  100 
 
 		 507 aa  1023    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  61.35 
 
 		 514 aa  639    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  66.89 
 
 		 497 aa  615  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  63.98 
 
 		 500 aa  559  1e-158  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  47.74 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  44.5 
 
 		 642 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  43.89 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  40.48 
 
 		 483 aa  325  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  39.56 
 
 		 481 aa  296  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  37.68 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  39.35 
 
 		 451 aa  293  6e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  38.85 
 
 		 454 aa  292  8e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  38.24 
 
 		 492 aa  281  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  39.52 
 
 		 484 aa  279  9e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  39.05 
 
 		 484 aa  278  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  38.57 
 
 		 482 aa  275  9e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  38.57 
 
 		 474 aa  273  6e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  37.38 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  35.37 
 
 		 413 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  32.99 
 
 		 422 aa  199  7e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  32.74 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  32.57 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  32.45 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  33.42 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  33.07 
 
 		 418 aa  193  8e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  34.26 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  27.56 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  27.38 
 
 		 498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  25 
 
 		 892 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  26.62 
 
 		 1001 aa  104  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  29.26 
 
 		 1092 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  32.42 
 
 		 320 aa  101  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  32.92 
 
 		 325 aa  101  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  31.96 
 
 		 324 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  32.58 
 
 		 315 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  32.58 
 
 		 315 aa  97.8  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  30 
 
 		 329 aa  97.8  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  32.58 
 
 		 315 aa  97.4  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  31.12 
 
 		 334 aa  95.9  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  31.51 
 
 		 322 aa  94.4  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  31.4 
 
 		 348 aa  94  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  31.73 
 
 		 326 aa  93.6  7e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  30.59 
 
 		 319 aa  93.6  8e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  28.12 
 
 		 329 aa  93.2  9e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  28 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  30.77 
 
 		 328 aa  90.1  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  30.45 
 
 		 318 aa  90.1  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  29.09 
 
 		 289 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  28.98 
 
 		 322 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  28.64 
 
 		 347 aa  87.8  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  30.43 
 
 		 315 aa  87.4  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  29.09 
 
 		 341 aa  86.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  26.7 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  29.39 
 
 		 942 aa  85.5  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  29.09 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  28.5 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  28.31 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  27.2 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  27.73 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  29.22 
 
 		 326 aa  82.8  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  29.61 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  29.41 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  24.47 
 
 		 764 aa  81.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  28.96 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  28.19 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  29.2 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  28.62 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  29.52 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  29.41 
 
 		 317 aa  76.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  27.4 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  29.19 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  29.91 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  26.48 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  26.32 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  29.49 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  26.91 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  28.31 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  22.57 
 
 		 725 aa  68.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  24.41 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  23.25 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  30.9 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  22.5 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  28.48 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  26.39 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  34.21 
 
 		 940 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2519  replication factor C small subunit 2  29.41 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.412171  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33013  predicted protein  23.08 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0011992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  26.27 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.62 
 
 		 735 aa  61.6  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  25.85 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  26.34 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  26.34 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  26.72 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.7 
 
 		 560 aa  60.8  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1868  Replication factor C  28.88 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  25.85 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  25.85 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  24.38 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  26.15 
 
 		 1015 aa  60.1  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>