More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2829 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
309 aa  625  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3250  undecaprenyl diphosphate synthase  66.99 
 
 
318 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  71.43 
 
 
304 aa  400  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  65.38 
 
 
340 aa  383  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  64.73 
 
 
325 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  54.8 
 
 
264 aa  277  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0107  undecaprenyl diphosphate synthase  53.82 
 
 
256 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0263  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.42 
 
 
292 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.94102  normal  0.931766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  50.59 
 
 
258 aa  256  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1788  undecaprenyl diphosphate synthase  51.01 
 
 
259 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.94 
 
 
283 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  50.2 
 
 
255 aa  245  9e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.494049 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  46.5 
 
 
263 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  48.57 
 
 
258 aa  236  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0118  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.94 
 
 
252 aa  226  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  42.91 
 
 
264 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  44.1 
 
 
264 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.32 
 
 
264 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  43.72 
 
 
264 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  44.9 
 
 
268 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  40.41 
 
 
263 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  40.93 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.5 
 
 
258 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  40.82 
 
 
278 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  39.59 
 
 
280 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.13 
 
 
262 aa  179  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  42.28 
 
 
255 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.06 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  39.15 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  36.02 
 
 
239 aa  172  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  35.97 
 
 
262 aa  171  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  38.19 
 
 
260 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  39.5 
 
 
240 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  40.79 
 
 
266 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.84 
 
 
253 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.79 
 
 
252 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.86 
 
 
258 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.41 
 
 
259 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.43 
 
 
252 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.76 
 
 
279 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 
259 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  40.26 
 
 
251 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.26 
 
 
253 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.26 
 
 
253 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  40.97 
 
 
264 aa  168  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  37.25 
 
 
259 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  39.65 
 
 
247 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  43.81 
 
 
245 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  41.41 
 
 
273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.4 
 
 
267 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.13 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1844  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.85 
 
 
243 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.81514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  38.13 
 
 
253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  39.27 
 
 
253 aa  165  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.05 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.93 
 
 
247 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.83 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0167  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.35 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00639838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  37.55 
 
 
271 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  38.16 
 
 
261 aa  163  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00172  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.35 
 
 
253 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0442077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3429  undecaprenyl diphosphate synthase  40.35 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00171  hypothetical protein  40.35 
 
 
253 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0178  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.35 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0176  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.35 
 
 
252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  39.91 
 
 
252 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0184  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.35 
 
 
253 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3486  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.35 
 
 
253 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000338142  normal  0.111087 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0185  undecaprenyl pyrophosphate synthase  40.35 
 
 
253 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0180399  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  37.89 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  38.21 
 
 
257 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.4 
 
 
254 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  36.48 
 
 
285 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  35.62 
 
 
282 aa  162  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  39.61 
 
 
256 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.8 
 
 
267 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  34.96 
 
 
267 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  36.25 
 
 
256 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  37.89 
 
 
263 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  36.48 
 
 
276 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0781  hypothetical protein  36.65 
 
 
288 aa  160  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  42.29 
 
 
254 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  36.51 
 
 
257 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.48 
 
 
282 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  38.06 
 
 
283 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3455  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.87 
 
 
246 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.65 
 
 
233 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1557  undecaprenyl diphosphate synthase  36.56 
 
 
254 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.243823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.77 
 
 
251 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  37.87 
 
 
249 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  37.4 
 
 
281 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  37.11 
 
 
255 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  39.68 
 
 
253 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 
249 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11991  undecaprenyl pyrophosphate synthase  33.89 
 
 
267 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.113196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1916  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.26 
 
 
250 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000170757  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.14 
 
 
255 aa  156  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.94 
 
 
258 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.63 
 
 
249 aa  155  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1800  undecaprenyl diphosphate synthase  35.19 
 
 
268 aa  155  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>