More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2484 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 263 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3298  ABC-2 type transporter  66.29 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  65.91 
 
 		 257 aa  319  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0327  ABC-2 type transporter  66.54 
 
 		 251 aa  319  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.461338  normal  0.0259517 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2803  ABC-2 type transporter  67.29 
 
 		 252 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  33.49 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  31.25 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  29.22 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 413 aa  79.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3044  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.14 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 339 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.16 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  30.26 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4202  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.62 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.32 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3479  ABC transporter protein  30.96 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  24.42 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  27.98 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  24.42 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  24.88 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  24.88 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  23.96 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  23.96 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  23.96 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.71 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  26.56 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.83 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  30.92 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0985  hypothetical protein  26.49 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.9 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  23.96 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1035  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.47 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0567  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.43 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  21.23 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  26.14 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  27.88 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0091  ABC transporter  26.8 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  24.27 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  26.46 
 
 		 376 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  25.65 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1307  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.94 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  27.33 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  25.14 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4838  ABC-2 type transporter  33.65 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120323  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  25.35 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  29.78 
 
 		 373 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  29.72 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 393 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 367 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 284 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1667  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0141124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.65 
 
 		 249 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  25.82 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 248 aa  52.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.73 
 
 		 384 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>