142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11880 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  100 
 
 		 159 aa  320  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  34.23 
 
 		 253 aa  89  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  31.08 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  28.47 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  37.41 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  34.46 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  34.75 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  33.1 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  29.05 
 
 		 214 aa  73.9  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  31.33 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  27.7 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  35.56 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  27.52 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  40.96 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  30.41 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  36.56 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  29.41 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  26.39 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  28.76 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  30.41 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  29.86 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  32.17 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  27.33 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  27.56 
 
 		 205 aa  67  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  28.78 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  28 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  37.21 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  37.21 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  29.17 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  26.67 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  24.52 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1334  recombination regulator RecX  30.14 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  30.23 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  28.08 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  24 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1159  regulatory protein RecX  36.57 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  36.05 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  27.54 
 
 		 199 aa  63.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  26.57 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  28.37 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  26.53 
 
 		 228 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  32.82 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  27.7 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23190  hypothetical protein  24.16 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  28.37 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  28.08 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  26.49 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  25.48 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  26.03 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0672  hypothetical protein  28.03 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.564441  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  27.4 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  24.68 
 
 		 254 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  28.37 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10730  hypothetical protein  32.43 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0103312  unclonable  0.00000000098721 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0939  regulatory protein RecX  27.03 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000896093  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0778  regulatory protein RecX  28.67 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000705154  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0457  recombination regulator RecX  29.2 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0961  regulatory protein RecX  27.03 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0184382  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1463  regulatory protein RecX  24.31 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000398524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  30.71 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1378  recombination regulator RecX  25.55 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.122405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1420  regulatory protein RecX  34.57 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  28.19 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  34.04 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2178  recombination regulator RecX  27.22 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1042  regulatory protein RecX  23.53 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  25.16 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  23.33 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  24.63 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1433  recombination regulator RecX  26.85 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.130729 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0437  recombination regulator RecX  29.93 
 
 		 270 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  24.83 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1243  regulatory protein RecX  26.45 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1889  recombination regulator RecX  27.22 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1546  regulatory protein RecX  23.03 
 
 		 201 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.953551  normal  0.0345212 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0422  recombination regulator RecX  26 
 
 		 258 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  32.56 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  27.07 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  25.74 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0285  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.315039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1461  regulatory protein RecX  22.44 
 
 		 223 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  27.97 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1615  regulatory protein RecX  23.19 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.384198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2438  regulatory protein RecX  25.97 
 
 		 213 aa  51.6  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000098324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1582  regulatory protein RecX  29.85 
 
 		 357 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3993  regulatory protein RecX  31.33 
 
 		 257 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.267659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2486  regulatory protein RecX  29.13 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1292  regulatory protein RecX  30 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0079197  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1618  regulatory protein RecX  28.12 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000117054  hitchhiker  0.000000000911842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3352  regulatory protein RecX  22.3 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  24.46 
 
 		 207 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4002  regulatory protein RecX  22.3 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.610217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1493  regulatory protein RecX  22.9 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  27.92 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02847  Regulatory protein RecX  26.77 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0519  recombination regulator RecX  29.68 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4804  recombination regulator RecX  29.68 
 
 		 270 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0102051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0571  recombination regulator RecX  29.68 
 
 		 270 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>