235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5729 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  100 
 
 		 389 aa  779    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  51.43 
 
 		 356 aa  283  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  50 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  47.49 
 
 		 337 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  48.66 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  50.86 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  51.25 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  50.18 
 
 		 342 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  51.67 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  49.45 
 
 		 342 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  47.72 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  48.9 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  34.95 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  36.27 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  34.74 
 
 		 305 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  32.98 
 
 		 309 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  32.98 
 
 		 309 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  32.98 
 
 		 305 aa  180  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  33.57 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  33.33 
 
 		 305 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  32.28 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  31.93 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  32.63 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  34.15 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  39.07 
 
 		 323 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  34.68 
 
 		 328 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  29.9 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  31.73 
 
 		 598 aa  144  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  31.79 
 
 		 524 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  31.86 
 
 		 380 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  31.86 
 
 		 380 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  31.54 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  31.45 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  32.78 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.48 
 
 		 315 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  33.89 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  28.1 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  27.87 
 
 		 313 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  28.01 
 
 		 315 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  29.25 
 
 		 530 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  26.8 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.19 
 
 		 315 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  26.89 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  26.89 
 
 		 315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  27.55 
 
 		 315 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  27.53 
 
 		 640 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  31.47 
 
 		 530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  27.36 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  30.56 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  30.29 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  31.27 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  30.89 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  31.33 
 
 		 503 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  27.27 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  27.3 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  29.28 
 
 		 505 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  30.75 
 
 		 397 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  29.62 
 
 		 459 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  30.55 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  27.55 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  31.14 
 
 		 371 aa  99.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  27.19 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0652  beta-lactamase  29.87 
 
 		 383 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0875652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  28.32 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  29.04 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  27.57 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  30.31 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  30.69 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  29.08 
 
 		 401 aa  96.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  28.16 
 
 		 476 aa  96.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  29.67 
 
 		 475 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  26.94 
 
 		 453 aa  96.3  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  29.27 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  27.95 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  27.58 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  32.4 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.72 
 
 		 468 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  28.76 
 
 		 368 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  27.64 
 
 		 475 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  29.25 
 
 		 372 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  28.95 
 
 		 491 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  27.16 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  29.66 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1227  beta-lactamase  30.71 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  28.25 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  30.43 
 
 		 483 aa  89.7  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  26.8 
 
 		 359 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  29.14 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  28.78 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02500  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.96 
 
 		 308 aa  87.4  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  25.24 
 
 		 395 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  27.2 
 
 		 466 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2024  beta-lactamase  27.33 
 
 		 468 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.770914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  27.76 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.69 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  27.24 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2128  beta-lactamase  24.83 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165199  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  27.16 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  27.18 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.07 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>