More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2528 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2528  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1053 aa  2100    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.263443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1050 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1011 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1026 aa  466  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01075  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.87 
 
 		 1026 aa  466  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2822  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1027 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000227615  normal  0.366957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1647  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1015 aa  459  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1923  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.11 
 
 		 1020 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1779  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1025 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1419  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.15 
 
 		 1019 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.446935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2383  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1021 aa  452  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2231  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 		 1040 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1828  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1025 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0227595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2277  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1015 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2194  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1030 aa  435  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1627  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 		 1018 aa  436  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1023 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1702  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1018 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2636  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1015 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.87 
 
 		 1044 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2516  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1015 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.560727  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1828  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1015 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.575203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1702  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1018 aa  426  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2523  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1015 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 		 1043 aa  409  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1034 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.75 
 
 		 1024 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1040 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1043 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.58 
 
 		 1044 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1046 aa  389  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1034 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1044 aa  372  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 		 1038 aa  365  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1017 aa  365  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1074 aa  364  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.08 
 
 		 1049 aa  362  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1083 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1034 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1022 aa  358  3.9999999999999996e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1038 aa  357  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  28.99 
 
 		 1085 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1006 aa  355  2.9999999999999997e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1102 aa  355  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  29.27 
 
 		 1085 aa  354  5e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1050 aa  354  5e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  27.76 
 
 		 1041 aa  353  8.999999999999999e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1085 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1085 aa  352  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1173 aa  352  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 		 1087 aa  352  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1087 aa  350  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.28 
 
 		 1041 aa  349  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  28.87 
 
 		 1087 aa  347  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  27.69 
 
 		 1064 aa  345  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.29 
 
 		 1050 aa  345  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  26.84 
 
 		 1038 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.74 
 
 		 1038 aa  343  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.74 
 
 		 1038 aa  343  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1038 aa  342  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1038 aa  342  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.39 
 
 		 1036 aa  342  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  26.74 
 
 		 1038 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  26.74 
 
 		 1038 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  26.55 
 
 		 1038 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 		 1041 aa  340  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1101 aa  340  7e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1038 aa  340  9e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1028 aa  339  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  25.92 
 
 		 1071 aa  338  1.9999999999999998e-91  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1015 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 		 1028 aa  337  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.11 
 
 		 1063 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 		 1067 aa  335  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.08 
 
 		 1122 aa  335  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1171 aa  335  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1048 aa  335  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.53 
 
 		 1039 aa  334  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1030 aa  334  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1028 aa  334  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  27.05 
 
 		 1039 aa  333  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1032 aa  333  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1038 aa  332  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 		 1027 aa  332  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1045 aa  332  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1058 aa  332  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00322  RND superfamily protein  30.07 
 
 		 823 aa  331  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1055 aa  331  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.88 
 
 		 1034 aa  330  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1028 aa  330  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  26.07 
 
 		 1014 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1470 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1058 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  24.64 
 
 		 1059 aa  327  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1036 aa  327  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.99 
 
 		 1024 aa  326  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1044 aa  326  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  30.34 
 
 		 1075 aa  326  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1039 aa  325  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1046 aa  324  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>