More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2233 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  100 
 
 
318 aa  622  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  47.77 
 
 
308 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  51.15 
 
 
304 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
301 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  43.09 
 
 
356 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  50.68 
 
 
304 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  51.58 
 
 
304 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  45.57 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  49.32 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  52.91 
 
 
313 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.29 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.05 
 
 
318 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  47.69 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  36.05 
 
 
321 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.34 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.66 
 
 
308 aa  172  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  44.25 
 
 
309 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
332 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  38.99 
 
 
289 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  41.12 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
244 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.05 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  35.03 
 
 
329 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  40.19 
 
 
313 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  40.09 
 
 
340 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 
311 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  40.19 
 
 
313 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  35.96 
 
 
344 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  31.09 
 
 
308 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.21 
 
 
316 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  37.1 
 
 
319 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.29 
 
 
337 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  39.55 
 
 
336 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  32.79 
 
 
305 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  39.21 
 
 
315 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
322 aa  156  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.87 
 
 
325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  36.22 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  36.65 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  36.65 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  35.04 
 
 
306 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  34.18 
 
 
312 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  31.73 
 
 
303 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  35.37 
 
 
326 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  38.36 
 
 
293 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  33.97 
 
 
326 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  41.35 
 
 
287 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  30.45 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  38.59 
 
 
340 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
308 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  45.62 
 
 
310 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  35.06 
 
 
302 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  36.44 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  35.93 
 
 
331 aa  152  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  36.4 
 
 
316 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  39.09 
 
 
307 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  37.78 
 
 
274 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  32.8 
 
 
310 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.29 
 
 
316 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  45.28 
 
 
283 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.77 
 
 
310 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.32 
 
 
317 aa  151  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
308 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  37.19 
 
 
341 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
310 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.55 
 
 
310 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  41.26 
 
 
313 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  37.27 
 
 
360 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  35.94 
 
 
310 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  33.23 
 
 
310 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  37.71 
 
 
306 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  33.54 
 
 
346 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  37.56 
 
 
339 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  37.67 
 
 
332 aa  149  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  40.97 
 
 
304 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  40.62 
 
 
311 aa  149  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  31.09 
 
 
303 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 
325 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  39.34 
 
 
308 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  38.64 
 
 
339 aa  149  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  42.56 
 
 
309 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  37.19 
 
 
457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  38.84 
 
 
235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  30.77 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  41.67 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  35.29 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.92 
 
 
342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  34.22 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  30.6 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.49 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.5 
 
 
311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  40.71 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  34.91 
 
 
344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  28.89 
 
 
369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.77 
 
 
331 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  31.78 
 
 
314 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  30.77 
 
 
303 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>