More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0719 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0719  integrase family protein  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2876  integrase family protein  94.15 
 
 		 241 aa  400  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0969  integrase family protein  97.56 
 
 		 245 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0781  integrase family protein  97.56 
 
 		 205 aa  383  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2804  integrase family protein  92.68 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000180357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0829  integrase family protein  67.61 
 
 		 213 aa  304  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0640  integrase family protein  67.14 
 
 		 213 aa  301  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0590  integrase family protein  67.14 
 
 		 213 aa  299  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1018  integrase family protein  67.46 
 
 		 209 aa  291  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.79 
 
 		 328 aa  78.2  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  26.9 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  32.81 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  33.16 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  32.81 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  30.93 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  30.11 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  30.21 
 
 		 284 aa  72  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  32 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  30 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  29.15 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  31.46 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.09 
 
 		 330 aa  64.7  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  28.65 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  29.9 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  24.74 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  30.26 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  29.56 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  29.56 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  27.96 
 
 		 289 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.48 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.94 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  27.98 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.26 
 
 		 450 aa  61.2  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  30.06 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.11 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.78 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  29.17 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  27.62 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.6 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  26.34 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.84 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.17 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  28.42 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  31.35 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.65 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.13 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  30.98 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  27.43 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  27.17 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  26.23 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  28.27 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  27.46 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  24.87 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  28.57 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  28.22 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  27.55 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  29.07 
 
 		 336 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  31.1 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  27.32 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  24.86 
 
 		 306 aa  58.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  28.25 
 
 		 312 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  28.57 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.7 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  30.72 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  29.41 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  30.81 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  27.22 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  27.39 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  27.32 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  31.05 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  26.94 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  30.91 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.87 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  29.09 
 
 		 380 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 300 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.35 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  30.12 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  30.3 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.47 
 
 		 300 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  30.72 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  26.04 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  27.01 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  25.42 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  26.7 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.95 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  26.73 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  30.91 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  28.12 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>