More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1187 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1187  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0250538  hitchhiker  0.00000123969 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  63.54 
 
 		 302 aa  329  4e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0091  MscS Mechanosensitive ion channel  63.53 
 
 		 297 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1042  MscS Mechanosensitive ion channel  62.92 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1895  MscS Mechanosensitive ion channel  53.01 
 
 		 286 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.461855 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  40.99 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  38.55 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  41.2 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  36.57 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  36.15 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  38.06 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 408 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  41.53 
 
 		 531 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  34.92 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  36.84 
 
 		 269 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  36.61 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  34.47 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 840 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  36.64 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 		 561 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  37.4 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  34.19 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  38.83 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 330 aa  136  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  38.33 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  35.19 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  33.61 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  39.77 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 341 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  34.19 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  39.77 
 
 		 544 aa  133  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5329  mechanosensitive ion channel protein MscS  36.41 
 
 		 331 aa  132  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  43.32 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 494 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 		 385 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  40.34 
 
 		 563 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  41.36 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.03 
 
 		 806 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 429 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  34.76 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 270 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 356 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 270 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  37.56 
 
 		 534 aa  129  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 276 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 404 aa  129  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  32.26 
 
 		 328 aa  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.77 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  34.66 
 
 		 275 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  40.34 
 
 		 532 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  35.5 
 
 		 540 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  33.49 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  37.31 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  30.32 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  36.79 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  29.32 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  40.34 
 
 		 547 aa  126  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 360 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 533 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  32.19 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 200 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  31.51 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 549 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 549 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 549 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 538 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 796 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  36.57 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  33.45 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0407  MscS mechanosensitive ion channel  35.35 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.323817  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 		 637 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  31.93 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4420  MscS mechanosensitive ion channel  34.27 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0689552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  32.19 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0476  MscS mechanosensitive ion channel  34.92 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 547 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>