More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1078 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  100 
 
 		 318 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  42.27 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0099  ROK family protein  41.32 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  42.28 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.9 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.9 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  28.9 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  29.55 
 
 		 429 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.08 
 
 		 422 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  29.72 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  28.79 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.5 
 
 		 414 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  30.23 
 
 		 397 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.52 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  30.59 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  31.75 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.68 
 
 		 392 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  32.03 
 
 		 403 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  30.46 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  29.77 
 
 		 302 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  27.6 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29 
 
 		 393 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  29.22 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  30.35 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  27.74 
 
 		 387 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.41 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.59 
 
 		 387 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  30.2 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  26.98 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  27.92 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  29.28 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  29.39 
 
 		 391 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  28.57 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.76 
 
 		 503 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2895  ROK family protein  32.93 
 
 		 305 aa  99.4  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  30.37 
 
 		 392 aa  99.4  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  30.13 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  29.26 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  27.06 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  33.02 
 
 		 398 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.8 
 
 		 409 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.5 
 
 		 399 aa  95.9  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  30.24 
 
 		 384 aa  95.9  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  27.18 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  30.31 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.63 
 
 		 396 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.27 
 
 		 389 aa  94  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.62 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  27.01 
 
 		 410 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  30.16 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  28.25 
 
 		 392 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  30.94 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  27.51 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  29.45 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  24.92 
 
 		 396 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  27.97 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  27.97 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  27.91 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  26.82 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  31.88 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.09 
 
 		 410 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.48 
 
 		 410 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  28.52 
 
 		 754 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  26.89 
 
 		 302 aa  89.7  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  27.73 
 
 		 393 aa  89.4  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  32.58 
 
 		 400 aa  89.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.8 
 
 		 391 aa  89.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  30.35 
 
 		 414 aa  89.4  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  30.99 
 
 		 367 aa  89  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.62 
 
 		 396 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.32 
 
 		 395 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  25.89 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  30.08 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  28.71 
 
 		 328 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  26.98 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  30.59 
 
 		 443 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  26.28 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  24.92 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.93 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  28.33 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  28.57 
 
 		 429 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  28.35 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  31.07 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  29.88 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  28.8 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  26.43 
 
 		 406 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  29.27 
 
 		 381 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  28.25 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  25.89 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  27.3 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  28.25 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  26.65 
 
 		 427 aa  86.7  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  27.9 
 
 		 340 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  27.06 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  27.24 
 
 		 390 aa  85.9  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  25.84 
 
 		 292 aa  85.9  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  25.32 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  28.79 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  27.44 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  37.4 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>