192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0732 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0732  permease  100 
 
 		 319 aa  622  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  41.94 
 
 		 319 aa  252  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  42.58 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  41.01 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  41.01 
 
 		 318 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  41.01 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  40.69 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  40.5 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  40.38 
 
 		 318 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  40.06 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  40.06 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  40.06 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  38.36 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  40.69 
 
 		 318 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  42.07 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  40.06 
 
 		 319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  43.37 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  43.37 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  43.69 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  38.83 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  38.73 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  39.19 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  40.47 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  38.49 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  40.71 
 
 		 316 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  36.89 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  34.8 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  36.07 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  33.44 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  35.46 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  33.87 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  33.87 
 
 		 315 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  33.23 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  33.77 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  34.82 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  33.87 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  34.5 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  36.42 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  30.53 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 		 309 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  28.37 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.54 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.01 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.37 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  29.24 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  26.49 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  28.03 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  26.39 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  26.39 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.15 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  27.61 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  27.3 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  30.35 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.67 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  25.95 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  29.5 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  25.62 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  27.7 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.6 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  29.08 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.83 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  24.33 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  24.73 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  21.33 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  28.1 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.27 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  27.46 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  31.21 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  25 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.48 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  22.57 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  21.95 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  26.94 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.37 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  22.73 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  22.26 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.7 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  28.15 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  23.44 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  22.73 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.18 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.61 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  22.38 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.81 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>