99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0109 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 539 aa  1124    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  78.41 
 
 		 537 aa  893    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  49.64 
 
 		 538 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  48 
 
 		 549 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  47.04 
 
 		 519 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  46.17 
 
 		 1033 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  39.16 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  41.84 
 
 		 524 aa  357  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  40.75 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  39.68 
 
 		 512 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  38.91 
 
 		 498 aa  333  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  38.85 
 
 		 516 aa  333  6e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  38 
 
 		 494 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  39.07 
 
 		 507 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  35.27 
 
 		 472 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  36.89 
 
 		 500 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  37.99 
 
 		 520 aa  320  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  37.69 
 
 		 500 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  37.01 
 
 		 500 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  36.15 
 
 		 511 aa  300  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  33.96 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  29.93 
 
 		 465 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  28.91 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  28.55 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  28.55 
 
 		 463 aa  183  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  28.25 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 450 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  24.47 
 
 		 465 aa  128  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.86 
 
 		 459 aa  123  7e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  24.66 
 
 		 459 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 		 722 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  24.95 
 
 		 448 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  24.13 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  23.09 
 
 		 449 aa  93.6  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  23.54 
 
 		 437 aa  90.1  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  23 
 
 		 436 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  22.47 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  21.51 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  23.89 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  22.48 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  21.84 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  26.21 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  21.39 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  20.11 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.61 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  21.33 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  21.77 
 
 		 452 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  22.79 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  23.55 
 
 		 419 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  25.13 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  34.25 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  21.51 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  21.95 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  41.18 
 
 		 557 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.25 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  45.76 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  19.76 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  27.78 
 
 		 575 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  32.03 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1855  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.23 
 
 		 579 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0230589  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1556  UDP-galactopyranose mutase  24.51 
 
 		 383 aa  47.8  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  44.07 
 
 		 436 aa  47.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  42.37 
 
 		 436 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  43.55 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  43.55 
 
 		 436 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  43.55 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  32.5 
 
 		 435 aa  47  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14591  UDP-galactopyranose mutase  22.84 
 
 		 394 aa  47  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  44.07 
 
 		 436 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  44.07 
 
 		 436 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.14 
 
 		 491 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1137  UDP-galactopyranose mutase  41.38 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  41.94 
 
 		 436 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  37.7 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20111  phytoene dehydrogenase and related proteins  41.38 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.428487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  43.64 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  41.18 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  41.03 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  39.24 
 
 		 460 aa  45.8  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  31.33 
 
 		 1293 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  21.51 
 
 		 428 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  21.7 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 516 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3835  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.8 
 
 		 485 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 475 aa  44.3  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  22.76 
 
 		 473 aa  44.3  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  32.05 
 
 		 468 aa  44.3  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  48.21 
 
 		 463 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  48.94 
 
 		 455 aa  43.9  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50.94 
 
 		 476 aa  43.9  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  39.74 
 
 		 520 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  33.33 
 
 		 949 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  54.76 
 
 		 468 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  54.76 
 
 		 468 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2898  UDP-galactopyranose mutase  35.21 
 
 		 393 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373026  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  35.53 
 
 		 467 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1528  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.16 
 
 		 681 aa  43.5  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.124714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>