More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0926 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  100 
 
 		 233 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1407  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  57.21 
 
 		 237 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000138709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2803  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  56.33 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0586673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  49.78 
 
 		 236 aa  241  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  44.25 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  45.78 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  45.78 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3220  response regulator receiver domain-containing protein  41.63 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.975965  hitchhiker  0.00188513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  40 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  40.44 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3263  response regulator  40.09 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  31.14 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0040  response regulator  28.02 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000155004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  39.81 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  37.96 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  42.59 
 
 		 460 aa  94.4  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 454 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 492 aa  93.2  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.79 
 
 		 310 aa  89  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.72 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 121 aa  87.8  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 363 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 576 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5113  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 121 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.38 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.04 
 
 		 349 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 121 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 129 aa  85.9  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  38.83 
 
 		 121 aa  85.5  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1242  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 138 aa  85.5  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  39.29 
 
 		 980 aa  85.5  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.86 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  37.74 
 
 		 151 aa  85.1  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  37.74 
 
 		 285 aa  85.1  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  33.9 
 
 		 457 aa  85.1  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1193 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  39.81 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  40.18 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 124 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 1193 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  37.96 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2975  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 124 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0989438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3017  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 124 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.203071 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 		 1160 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 121 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 124 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 126 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  31.28 
 
 		 1816 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 		 970 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  38.32 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 1033 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  33.9 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.51 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 121 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  36.94 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  37.96 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  34.75 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.38 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  36.61 
 
 		 466 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  37.4 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5042  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  33.33 
 
 		 676 aa  83.2  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  37.96 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  34.75 
 
 		 457 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.04 
 
 		 469 aa  82.8  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  35 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  34.44 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 1016 aa  82.8  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 464 aa  82.4  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 1792 aa  82  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  33.9 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1407 aa  82  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 376 aa  82  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  36.75 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 123 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  35.09 
 
 		 1060 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  33.94 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  36.45 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  36.61 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  33.94 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1572  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 132 aa  81.3  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>