More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1964 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  100 
 
 		 244 aa  504  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0040  response regulator  34.09 
 
 		 239 aa  138  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000155004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  28.51 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.14 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.57 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  32.17 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2803  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  28.07 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0586673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3220  response regulator receiver domain-containing protein  26.11 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.975965  hitchhiker  0.00188513 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1407  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  27.63 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000138709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  30.4 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3263  response regulator  29.26 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  27.83 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  26.42 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6704  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  25 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2329  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  40 
 
 		 760 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1508  type IV pilus assembly PilZ  38.89 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1814  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  36.17 
 
 		 843 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  26.09 
 
 		 1177 aa  62.4  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1523  2-alkenal reductase  37.04 
 
 		 759 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  27.43 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0298  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.7054  normal  0.177262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0713  response regulator receiver protein  28.45 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  30.08 
 
 		 961 aa  58.2  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 1274 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2382  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.91 
 
 		 359 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  23.74 
 
 		 1127 aa  57  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0512  response regulator PleD  25.76 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4589  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  41.11 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.527063  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  22.31 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  29.13 
 
 		 458 aa  54.7  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  23.68 
 
 		 120 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  26.4 
 
 		 161 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0962  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 381 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 		 1158 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2709  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 129 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000626377  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  29.13 
 
 		 458 aa  54.3  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 394 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1598  type IV pilus assembly PilZ  31.48 
 
 		 118 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1503  type IV pilus assembly PilZ  31.48 
 
 		 118 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.57 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1798  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 421 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0425033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 564 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.39 
 
 		 457 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  28.95 
 
 		 461 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3501  type IV pilus assembly PilZ  35.11 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.424652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1392  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.7 
 
 		 584 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4722  type IV pilus assembly PilZ  35.62 
 
 		 165 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.992615  normal  0.959626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3669  diguanylate cyclase  26.06 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4179  response regulator receiver protein  25.2 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4244  response regulator receiver  26.72 
 
 		 120 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.231952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2180  response regulator receiver  22.95 
 
 		 151 aa  52.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.269305  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  28.43 
 
 		 457 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  28.43 
 
 		 460 aa  52.4  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2960  response regulator receiver  25.95 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0852903  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  22.22 
 
 		 314 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2361  hypothetical protein  30.56 
 
 		 118 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 		 1977 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.42 
 
 		 529 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  25.41 
 
 		 126 aa  52.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  24.14 
 
 		 1111 aa  52  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2419  2-alkenal reductase  32.08 
 
 		 771 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  28.43 
 
 		 457 aa  52  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2331  2-alkenal reductase  32.08 
 
 		 778 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0761037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4236  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.89 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0979  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.36 
 
 		 816 aa  52  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.58 
 
 		 317 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.58 
 
 		 317 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  29.41 
 
 		 457 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.79 
 
 		 767 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1614  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 779 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  25.22 
 
 		 132 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1519  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 778 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  21.55 
 
 		 123 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.41 
 
 		 948 aa  51.6  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2350  DnaK family protein  33.33 
 
 		 782 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.646727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.48 
 
 		 351 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1839 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  31.71 
 
 		 466 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  25 
 
 		 1128 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.56 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4015  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.89 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3524  two component LuxR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.406085  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1857 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  27.86 
 
 		 1278 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  24 
 
 		 2284 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  24.22 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  24.35 
 
 		 123 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  29.41 
 
 		 457 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2977  response regulator receiver domain-containing protein  25.41 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.13601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  31.15 
 
 		 1695 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>