More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3263 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3263  response regulator  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3220  response regulator receiver domain-containing protein  50.88 
 
 		 233 aa  245  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.975965  hitchhiker  0.00188513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0877  response regulator  45.49 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3986  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  43.23 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.694656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  40.09 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1407  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.6 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000138709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2803  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.16 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0586673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  38.79 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0710  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  37.07 
 
 		 240 aa  164  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0075  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  33.8 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.124346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0058  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  31.78 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000220235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1964  response regulator CheY  29.26 
 
 		 244 aa  99  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0118313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0040  response regulator  25.82 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000155004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 132 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 120 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 944 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  36.36 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 		 1788 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  32.43 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  31.71 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  34.13 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 827 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 1771 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0355  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.384709  normal  0.97064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 1839 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.21 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1784 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1786 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1782 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  37.39 
 
 		 1200 aa  79  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 1857 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 1240 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 916 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1792 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 123 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 123 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.56 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 123 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1141 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  36.72 
 
 		 1137 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  28.7 
 
 		 123 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.29 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4279  response regulator receiver protein  27.19 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  31.71 
 
 		 556 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  34.48 
 
 		 896 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  38.1 
 
 		 1023 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 1137 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2975  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0989438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  33.96 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  37.93 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1924  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.620973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  34.48 
 
 		 896 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  34.55 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3017  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.203071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1159 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1216 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1767 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1767 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 846 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3604  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 619 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.562878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  28.49 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 1767 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 1352 aa  75.5  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2179  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.9 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.86 
 
 		 1765 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 896 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 1271 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0986  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 433 aa  75.1  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0645349  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 1131 aa  75.1  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  33.62 
 
 		 896 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  31.9 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  35.65 
 
 		 457 aa  75.1  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1160 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  32.05 
 
 		 356 aa  75.1  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 1177 aa  75.1  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  32.76 
 
 		 896 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 896 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.64 
 
 		 1177 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  33.62 
 
 		 896 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  32.76 
 
 		 896 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 896 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  38.24 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  31.03 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 125 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 2539 aa  74.7  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>