More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0592 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  53.64 
 
 
963 aa  1026    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  44.89 
 
 
929 aa  757    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  47.06 
 
 
932 aa  812    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  54.69 
 
 
975 aa  1047    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  45.77 
 
 
960 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  42.37 
 
 
951 aa  713    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  49.23 
 
 
966 aa  907    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  61.95 
 
 
665 aa  847    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  64.52 
 
 
964 aa  1260    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  100 
 
 
955 aa  1957    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  48.55 
 
 
942 aa  870    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  48.6 
 
 
947 aa  851    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  58.13 
 
 
963 aa  1149    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.8 
 
 
961 aa  674    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  48.05 
 
 
949 aa  885    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  48.45 
 
 
967 aa  890    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  40.94 
 
 
961 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  45.68 
 
 
921 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  45.23 
 
 
916 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  45.54 
 
 
915 aa  522  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  45.23 
 
 
915 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28 
 
 
584 aa  206  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.84 
 
 
988 aa  205  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0036  hypothetical protein  34.76 
 
 
363 aa  201  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.922282  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.32 
 
 
584 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  28.76 
 
 
554 aa  198  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.56 
 
 
1144 aa  193  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  30.25 
 
 
835 aa  193  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  29.59 
 
 
1138 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.35 
 
 
1129 aa  187  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 
1145 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.91 
 
 
1116 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  30.69 
 
 
962 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.54 
 
 
969 aa  181  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  31.19 
 
 
1160 aa  181  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
1167 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.51 
 
 
1147 aa  180  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.08 
 
 
941 aa  180  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.08 
 
 
941 aa  180  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.63 
 
 
966 aa  180  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.36 
 
 
1062 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.98 
 
 
1212 aa  179  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  30.56 
 
 
1169 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  29.43 
 
 
1172 aa  174  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  30.79 
 
 
1169 aa  174  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  29.08 
 
 
1136 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.18 
 
 
933 aa  173  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  30.78 
 
 
1170 aa  172  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  28.06 
 
 
922 aa  171  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  30.44 
 
 
1167 aa  171  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  29.48 
 
 
1167 aa  171  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  29.34 
 
 
877 aa  170  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  29.48 
 
 
972 aa  169  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  28.55 
 
 
829 aa  168  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.91 
 
 
1170 aa  167  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  29.97 
 
 
1170 aa  167  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  30.29 
 
 
1201 aa  167  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
1201 aa  167  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  27.36 
 
 
969 aa  165  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  27.98 
 
 
1137 aa  165  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  30.02 
 
 
1170 aa  165  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  30.98 
 
 
1172 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  29.58 
 
 
925 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.32 
 
 
964 aa  163  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.58 
 
 
1095 aa  160  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  30.18 
 
 
1194 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  28.69 
 
 
1160 aa  158  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  29.72 
 
 
1057 aa  157  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  28.16 
 
 
927 aa  156  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  28.64 
 
 
1038 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.66 
 
 
937 aa  153  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.97 
 
 
1168 aa  153  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.03 
 
 
900 aa  151  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.99 
 
 
1028 aa  149  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.04 
 
 
971 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  28.45 
 
 
1165 aa  149  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.32 
 
 
801 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  28.77 
 
 
1044 aa  145  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.68 
 
 
805 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  30.41 
 
 
1131 aa  142  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  27.21 
 
 
919 aa  139  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  26.38 
 
 
894 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  27.45 
 
 
1031 aa  135  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  34.12 
 
 
572 aa  134  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  25.66 
 
 
952 aa  130  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.66 
 
 
1045 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  32.34 
 
 
467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  34.67 
 
 
560 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  38.92 
 
 
555 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  34.67 
 
 
560 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  34.67 
 
 
560 aa  125  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  34.67 
 
 
560 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  34.67 
 
 
560 aa  125  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  34.67 
 
 
560 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  34.67 
 
 
560 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  34.67 
 
 
560 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  34.67 
 
 
560 aa  126  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  23.9 
 
 
1013 aa  124  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  34.67 
 
 
560 aa  124  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  26.66 
 
 
1082 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>