More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3693 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 325 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  30.73 
 
 		 238 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  35.26 
 
 		 240 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  31.37 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  49.18 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.33 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.76 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  50.88 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.13 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.44 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.13 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.13 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 217 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  41.38 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.51 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 326 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  45.16 
 
 		 264 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  39.34 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  43.4 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  37.93 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 224 aa  48.5  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  40.74 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>